在全长16S基因测序样本量中,增加基因测序样本量量(CCS的数目)是否可以得到更好的结果(分辨率)呢

随着人类基因组计划的完成人類对自身遗传信息的了解和掌握有了前所未有的进步。与此同时分子水平的

基因检测技术平台不断发展和完善,使得基因检测技术得到叻迅猛发展基因检测效率不断提高。从最初第一代以

基因测序样本量为代表的直接检测技术和以连锁分析为代表的间接基因测序样本量技术到

技术为标志的新一代基因测序样本量

的相继出现,基因测序样本量效率明显

基因检测手段有了革命性的变化

极大地提高了基因檢测的检出率,并扩展了疾病在基因水平的研究范围

月,约翰霍普金斯大学的研究

外显子基因测序样本量技术发现了一个新的遗传性胰腺癌的致病基因

基因测序样本量技术成功应用于致病基因的鉴定研究。同年

技术发现罕见弗里曼谢尔

》发表了遗传疾病米勒综合征致疒基因。此后通过

传相关的致病基因不断被发现,

技术已成为里程碑式的进步

杂志将这一技术评选为当年

近两年,基因检测成为临床診断和科学研究的热点得到了突飞猛进和日新月异的发展,越来越多的临床

和科研成果不断涌现出来同时,基因检测已经从单一的遗傳疾病专业范畴扩展到复杂疾病和个体化应用更加广阔

的领域其临床检测范围包括高危疾病的新生儿筛查、遗传疾病的诊断和基因携带嘚检测以及基因药物检测用于指

导个体化用药剂量、选择和药物反应等诸多方面的研究。目前基因检测在临床诊断和医学研究的应用正樾来越受

到医生的普遍重视和引起研究人员的极大的兴趣。

水平基因检测常见的方法比较其优缺点和在临床诊断和科学研究中的应用,對指

导研究生和临床医生课外学习推进临床科研工作和提升科研教学水平有着指导意义。

等发明了双脱氧链末端终止法

术随后成为最為常用的基因基因测序样本量技术。

年里成为基因检测的金标准其基本原理即双脱氧核苷三磷酸

种含有不同的放射性同位素标记的核苷酸的

一的片段,大量起始点相同、终止点不同的

片段存在于反应体系中具有单个碱基差别的

聚丙烯酰胺变性凝胶电泳分离出来,得到放射性同位素自显影条带依据电泳条带读取

人类基因组的基因测序样本量正是基于该技术完成的。

基因测序样本量这种直接基因测序样本量方法具有高度的准确性和简单、

依然对于一些临床上小样本遗传疾病基因的鉴定具有很高的实用价值

公司主要依托高通量基因测序样夲量技术和生物信息分析技术建立了通量规模领先 的基因基因测序样本量平台,并结合多组学研究技术手段为生命科学基础研究、医學及 临床应用研究提供多层次的科研技术服务及解决方案;同时,基于在基因基因测序样本量 及其应用领域的技术积累自主开发创新的基洇检测医疗器械。

在创新驱动和效率驱动的研发战略导向下公司搭建了通量规模领先、测 序质量稳定、高效交付的基因基因测序样本量岼台,并始终在各项高难度基因基因测序样本量技术保 持领先地位全面掌握基因组学、蛋白质组学、代谢组学及多组学整合研究技 术体系,形成从基础研究、转化研究到临床应用的跨领域协同优势最近 5 年 在国际期刊累计发表署名论文 75 篇,包括 Nature 及其子刊在内的高级别国际期 刊论文 26 篇(影响因子>10)取得基因基因测序样本量技术相关发明专利 32 项、软件著 作权 173 项。

公司构建了全球化的技术服务网络在境内设有天津、南京中心实验室, 在新加坡、美国、英国建立了本地化运营的实验室和子公司于香港、荷兰、 日本等发达国家和地区设有子公司,業务覆盖全球六大洲超过 60 个国家和地 区实现对北美、欧洲、东南亚等本地科研需求的快速响应,全面覆盖中国科 学院、中国医学科学院、北京大学、清华大学、Stanford University、Johns Hopkins

公司积极开拓基因技术在临床应用的发展公司第三类医疗器械“人 EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1 基因突变检测试剂盒(半导体测 序法)”于 2018 年 8 月通过 NMPA 创新医疗器械特别审评通道审批上市,成为 我国首批获准上市的基于高通量基因测序样本量的肿瘤基因检测试剂盒之一

公司经营业绩保持高速成长。最近三年公司主营业务收入依次为 73,920.93 万元、105,268.06 万元和 153,482.27 万元,年均复合增长率 44.08%; 扣除非经常性损益后归属于母公司股东的净利润分别为 5,620.52 万元、8,449.98 万元和 10,058.93 万元年均复合增长率为 33.78%。

根据立信出具的标准无保留意见审计报告(信会师报字[2020]第 ZG10116 号)发行人 2019 年度营業收入为 153,482.89 万元,2017 年、2018 年、2019 年经营活动产生的现金流量净额分别为 5,477.06 万元、15,143.11 万元和 8,535.84 万元累计不低于 1 亿元。结合同行业上市公司及可比公司的估值情况预计发行人上市后的总市值不低于

因此,公司适用《上海证券交易所科创板股票上市规则》第 2.1.2 条第三项 之上市标准:“预计市值鈈低于人民币 20 亿元最近一年营业收入不低于人民币 3 亿元,且最近三年经营活动产生的现金流量净额累计不低于人民币 1 亿元”

截至本招股说明书签署日,诺禾股份的股权结构图如下:

公司产品主要包括生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库基因测序样本量平台垺务主要产品及用途如下:

公司主营业务收入构成情况如下:

公司以基因研究技术为主线,并进一步掌握基因组学、蛋白质组学、代谢 组学忣多组学研究手段为生命科学基础研究、医学及临床应用研究提供整合技术解决方案;并基于在基因基因测序样本量及其应用领域的技术積累,向临床应用延伸自主开发创新的基因检测医疗器械。

在第二代基因测序样本量技术的推动下基因基因测序样本量的应用领域迅速拓宽,市场规模快 速增长根据 BCC Research,全球基因基因测序样本量市场于 2018 年达到 107 亿美元预 计未来几年依旧会保持快速增长,2023 年将达到 244 亿美元 年复合 增长率为 18%;其中,基因基因测序样本量服务市场规模将由 2018 年的 55 亿美元增长到 2023 年的 140 亿美元复合增长率为 20.4%。中国基因基因测序样本量市场规模于 2017 年 达到 12 亿美元预计 2022 年将达到 29 亿美元,复合增长率为 19%;其中基因 基因测序样本量服务市场规模将于 2017 年的 6.18 亿美元增长到 2022 年的 18 亿美元复合 增长率为 24.4%。

基因基因测序样本量产业的上游为基因测序样本量设备及其试剂生产商主要竞争者为跨国企 业,包括Illumina、Thermo Fisher等中游为基洇测序样本量服务提供商,主要包括诺禾致源、华大基因等下游为应用场景,包括基础科研、临床应用及个人消费级产 品发行人主要從事中游基因测序样本量服务,并基于相关技术积累向下游场景应用延 伸,提供基因基因测序样本量医疗器械等临床应用产品

中游企業通过搭建整合的基因测序样本量平台为下游科研应用等提供基因测序样本量技术服务, 在产业链上主要承载如下功能:1通过强大而完善的實验操作技术及生物信息 分析技术使得标准化的基因测序样本量仪器可广泛适用于不同物种、不同组织部位样 本、不同形态(如保存方式、保存时间差异等)等场景,以及 DNA、RNA、转 录组、宏基因组、单细胞基因组、三维染色体等不同微观类型并最终对序列 信息作解读。特别是②代基因测序样本量读长短需要将完整的 DNA 序列打断成小片段, 再经由生物信息分析手段重新拼接组装对实验技术和生物信息技术均有較高 的要求。2基于自身的技术和平台的全面性优势与规模优势在基础基因测序样本量技术 变革的基础上,进一步降低基因基因测序样本量的成本、缩短基因测序样本量周期降低基因基因测序样本量的 门槛,成为基因基因测序样本量技术在基础科研和商业化应用的大规模普及的重要推动 力3进一步整合基因组学、蛋白质组学、代谢组学等技术,结合生物信息分 析能力以最新的技术和综合性解决方案,助仂科学家探索前沿未知领域

下游应用包括科研、临床和个人消费三大类别。基础科研又可分为生命科 学基础研究、医学及临床应用研究兩方面客户包括科研院所、药品研发企 业、医院等。临床应用主要包括基因基因测序样本量诊断试剂等医疗器械类产品如NIPT产品、肿瘤基因检测试剂盒等。个人消费级产品尚处于初期发展阶段有赖于生命科学基础研究的深入发展。

全球基因基因测序样本量行业的市场规模巨大随着基因基因测序样本量相关技术的持续革新和 应用领域的深入发展,行业竞争格局也在不断演化基因基因测序样本量的产业鏈上游为 基因测序样本量仪器、设备和试剂供应商,在二代基因测序样本量领域仪器与试剂主要由 Illumina、 Thermo Fisher 等国外厂商提供;中游为基因基因测序样本量服务提供商;下游为使用者, 包括医疗机构、科研机构、制药公司诺禾致源主要面对来自基因基因测序样本量服务提 供商的竞争。

基因基因测序样本量服务提供商根据客户类别的不同主要分为两大类,一是面向基 础研究的基因基因测序样本量服务提供商;二是面向終端用户的临床、医疗类的基因检测 服务提供商服务内容以无创产前基因检测为主,还包括药物靶向治疗检测、 遗传缺陷基因检测、肿瘤基因检测、病原微生物检测、疾病风险评估等第一类服务提供商包括国内的诺禾致源、百迈克以及韩国的 Macrogen 等,第二类服务提供商包括艾德生物、燃石医学、世和基因等华大基因、贝瑞基因、安诺优达等公司则两种服务均有所涉及。

公司主要竞争对手为面向基础研究的基因基因测序样本量服务提供商包括国内的华

大基因、贝瑞基因、安诺优达、百迈克以及韩国的 Macrogen 等。

深圳华大基因股份有限公司成立于 2010 姩主营业务为通过基因检测等手 段,为医疗机构、科研机构等企事业单位提供基因组学类的诊断和研究服务 华大基因主要服务于国内外的科研院校、研究所、独立实验室、制药公司等机 构,以及国内外的各级医院、体检机构等医疗卫生机构、公司客户和大众客 户公司產品包括生育健康基础研究和临床应用服务、基础科学研究服务、复 杂疾病基础研究和临床应用、药物基础研究和临床应用等。2017 年 7 月华夶 基因在深圳证券交易所创业板上市。

公司是一家先进的创新型生物科技公司致力于实现基因基因测序样本量技术向应用 的全面转化,專注于用基因测序样本量技术促进生命科学的研究公司主要业务为以高通 量基因测序样本量技术为基础的基因检测和设备、试剂销售。其中基因检测分为医学产 品及服务和基础科研服务。公司的医学产品及服务分为医疗检测服务、试剂销 售和设备销售公司医疗检测服務主要分为遗传学和肿瘤学两个应用方向。公 司从成立之初就开始建设具有国际标准的研发、生产、市场、销售和客户服务 体系始终保歭与国内外一流的科研院所、高等院校和医疗机构的合作与交 流,客户覆盖国内外的医疗机构、科研机构、高等院校以及各行业的企业

咹诺优达基因科技(北京)有限公司成立于 2012 年,总部位于北京在浙 江、江苏等地设有分中心或子公司,专注于新一代基因组学技术在人类医學健 康和生命科学研究两大领域的产业化应用在医学健康领域,安诺优达推出了 包括无创产前 DNA 检测、ctDNA 检测、NGS 肿瘤个体化用药指导基因检測、血 液病基因检测、乳腺癌/卵巢癌基因检测在内的一批高通量基因测序样本量临床应用项目; 在科技服务领域安诺优达涉及领域包括人類重大疾病基础研究、动植物分子 育种、遗传与进化、环境微生物和生态等。

北京百迈客生物科技有限公司成立于 2009 年百迈客基于高通量基因测序样本量和生 物信息技术的开发与应用,开展科技服务、医学基因检测和生物云平台等主体 业务主要服务于国内外的科研院校、研究所、独立实验室、制药公司、农业 育种公司等机构,以及医疗卫生机构、公司客户和大众客户

Macrogen, Inc 于 1997 年基于首尔大学医学院基因医药研究所成立,现已发 展为国际性的基因基因测序样本量服务提供商提供基因基因测序样本量、生物信息等多方位的服 务。2017 年-2019 年Macrogen 的营业收叺为 1,017.93 亿韩元、1,128.31 亿韩元 和 1,222.53 亿韩元,净利润为 92.75 亿韩元、17.07 亿韩元和-133.83 亿韩元

公司主要产品在报告期内的产能、产量与销售情况如下:

公司采用实验Φ心集中化生产模式,由实验中心根据实际需求统一动态 调配产能在不同产品之前的分配,因此产能统计不区分服务类型报告期内, 公司持续引入新型基因测序样本量仪器并不断优化基因测序样本量流程,提升基因测序样本量效率从而持续 扩大产能。

公司主营业务收入的产品构成情况如下:

公司的服务报价与客户所要求的基因测序样本量产品类别、样本量大小、基因测序样本量深度等 因素有关不同類别和技术要求的项目报价差异较大。受到技术革新、基因测序样本量成 本下降、市场竞争以及业务结构变化的影响报告期内公司基因測序样本量服务价格总体 呈下降趋势,2018 年、2019 年的单 GB 基因测序样本量平均价格较上年度分别下降 13.11% 和 19.44%2019 年价格下降幅度较大,主要系建库基因測序样本量平台与服务板块中的自 建库业务服务内容较为简单服务价格较低,其 2019 年的收入占比有所上升

报告期内,根据客户基因测序樣本量服务销售额排名前五大客户如下:

公司客户主要为高校、科研机构、研究性医院、药企等企事业单位其 中,北京泽柏斯特医疗科技囿限公司系公司下属天津医检所的代理商协助天津医检所处理与个人客户对接、合同签订、收款、采样、存储、运输等一系列 前置程序,样本送到天津医检所后由其进行基因测序样本量及分析,出具检测报告由 代理商交付给个人客户。2017 年度天津医检所与北京泽柏斯特医疗科技有限 公司发生业务的金额为 2,267.87 万元。2017 年开始发行人加大了检测试剂研 发投入,拟以试剂销售逐步替代对个人客户的基因测序样夲量服务因此自 2018 年起不再 与该公司发生交易。

公司主营业务收入的区域构成情况如下:

公司采购的主要原材料主要包括在提取、建库、基洇测序样本量等各环节所使用的试 剂、耗材等报告期各期,公司采购额相对较大且较为持续的代表性试剂单价变化趋势如下表:

公司核心試剂采购价格与采购规模关系较大随着公司业务规模不断上 升,原材料采购量也不断增大因此在与供应商就价格进行谈判时能够获得較 低的供货价格。报告期内公司核心试剂价格多数呈下降趋势。Illumina 试剂 1 的采购价格于 2018 年上升幅度较大主要系该试剂于 2017 年上市之初,公司莋 为首批试用用户获得了较大折扣,而 2018 年恢复为正常价格所致;Illumina 试剂 2 的采购价格于 2019 年有所上升主要系公司基因测序样本量平台更新换代,该试剂 的采购量有所下降所致

公司主要原材料及服务的采购金额(不含税)、数量、单价及占总采购金额(不包含计入固定资产的设备采购金额)的比例如下:

报告期内,公司前五大供应商如下:

基因基因测序样本量的产业链上游为基因测序样本量仪器和试剂供应商;中游为基因基因測序样本量服务提供商;下游为使用者包括医疗机构、科研机构、制药公司。该等产业链不同 环节的划分系行业分工、提升专业化水平囷运营效率所需,经过较长时间市 场化发展后所形成的较为稳定的行业格局。

报告期内公司采购内容主要是各类基因测序样本量仪器忣试剂。由于 Illumina 和 Thermo Fisher 系上游仪器、试剂领域较为领先的提供商具有一定的技术优 势,在全球占有较大的市场份额因此,发行人选择主要与其进行合作报告 期内,公司向第一大供应商采购占采购总额的比例超过了 50%发行人系中游 基因测序样本量服务提供商中业务规模较大、市场地位较为领先的企业,仪器和试剂的采 购量也相应较大双方具有长期稳定的商业合作关系。

(二)净资产收益率和每股收益

报告期内公司营业收入稳步增长分别为 73,934.90 万元、105,356.17 万元 和 153,482.89 万元, 年公司营业收入年均复合增长率约为 44.08%

公司主营业务突出,报告期内主营业务收入占营業收入均超过 99%公司 主要依托高通量基因测序样本量技术,结合其他基因检测方法为科研机构、高校、医疗 机构、药业等企事业单位提供基因检测和生物信息分析等研究服务。公司其他 业务收入主要为房租收入

主营业务收入构成及变动分析

报告期内,公司主要业务板块包括生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务和建库基因测序样本量平台服务其中生命科学基础科研服务收入在整体主营业务 收入Φ的占比较大。

主营业务收入的地域分布

主营业务收入的季节性分析

受高校和研究机构的结算和付款制度影响公司客户通常于上半年进荇科 研项目的设计及经费申请,其后进行项目实施因此一般在第四季度项目执行 和结算较为密集。2017 年至 2019 年公司下半年主营业务收入所占比重分别为 62.39%、61.69%和 62.86%。

原标题:【问答集锦】轻松入门微生物组学看这一篇就够了!

近年来,随着DNA/RNA、蛋白质以及代谢物检测分析技术的迅速发展以及计算能力的飞速提升,聚焦于微生物组嘚研究正以指数级的速度迅猛增长作为目前当红的研究热点,微生物组学可谓“集万千宠爱于一身”已广泛应用于人体/动物、自然/工業等各种环境体系的微生物群落研究中。

微生物组、微生物群、宏基因组、代谢组……面对一长串令人眼花缭乱的概念术语、研究技术、汾析方法您是不是也会感到困惑,不知从何入手呢本期的微生物组问答集锦,就将为您答疑解惑精准把握核心知识点,避免混淆和誤解助您快速入门微生物组!

1、微生物组和微生物群,傻傻分不清楚

微生物组(Microbiome),指生态群落中的全体微生物(细菌、古细菌、低等或高等真核生物和病毒等各种生命体形式)的基因组(基因集合)及其在所处生境内所产生的全部物质信息。这个定义是基于Biome(生物群落)而形成的囊括了生态环境中的所有生物和非生物因素。

与Microbiome相对的是Microbiota常用来指代“微生物群”,指的是特定环境中存在的微生物群体的集合早期有研究使用Microflora来表述“微生物群”的概念,但这一词汇已经不适用于微生物组研究领域被时代淘汰了。

2、微生物组研究主要使用哪些高通量基因测序样本量技术

目前普遍采用二代Illumina和三代PacBio基因测序样本量技术开展微生物组研究。其中二代Illumina基因测序样本量技术根据通量、读长等技术指标,有MiSeq、NovaSeq等基因测序样本量系统采用的是双末端(Paired-end,PE)基因测序样本量即在待测DNA片段的正反两条链上,各自从5’端开始测定相同碱基数的序列,目前常见的双末端基因测序样本量模式有PE150、PE250和PE300(也可表示成2×150、2×250和2×300150/250/300是指双末端各自测定嘚碱基数);而三代PacBio基因测序样本量则通过单分子实时基因测序样本量技术(Single molecule real-time sequencing,SMRT)对DNA序列实现单分子级别的超长读长基因测序样本量,並通过环形一致性基因测序样本量模式(Circular-consensus sequenceCCS),极大地提高单碱基基因测序样本量的准确率因而具有无需PCR扩增富集、超长读长、碱基检測无偏好性和系统性偏差、一致性准确率高、原位实时直接检测DNA修饰等优势。

目前二代Illumina基因测序样本量技术可用于多样性组成谱基因测序样本量(以PE250/PE300基因测序样本量模式为主)和宏基因组/宏转录组基因测序样本量(以PE150基因测序样本量模式为主),而三代PacBio基因测序样本量技術主要应用于多样性组成谱基因测序样本量(通量不及二代Illumina基因测序样本量但能测定目标基因的全长信息,因而对于优势物种的注释而訁更为精准)

3、什么是16S rRNA基因?ITS序列又是什么

16S rRNA基因指原核微生物(细菌和古菌)染色体上编码核糖体(Ribosome)RNA的16S(S是沉降系数)小亚基(Subunit)嘚基因序列。该基因存在于所有原核微生物的基因组中相当于一个“分子时钟”,序列会随着物种的多样化而发生进化它既含有高度保守的序列区域,又有中度保守和高度可变的序列区域利用保守区序列设计引物,从而能够将16S rRNA基因片段进行PCR扩增并基因测序样本量这樣就能根据可变区序列的差异,对不同种属的微生物进行物种鉴定和分类

细菌/古菌16S rRNA基因常用基因测序样本量引物及其对应区域

三代PacBio平台囷二代Illumina平台的基因测序样本量模式示意图

ITS序列全称为Internal transcribed spacer,即内转录间隔区序列是真核生物核糖体RNA(rRNA)基因非转录区的一部分,常用于真菌類群的物种鉴定和群落组成分析用于真菌物种鉴定的ITS包括ITS1和ITS2两个区域。其中ITS1位于真核生物18S rRNA基因和/articles/d214-9)

study,即全微生物组关联分析对于微苼物组研究,除了通过基因测序样本量和差异统计分析来筛选各组样本中的微生物标志物种或基因(Biomarker)的信息外我们还需要将其它各种檢测手段获得的数据,比如代谢组、蛋白组、或检测获得的理化指标、临床指标等各类数据与微生物组的海量数据进行关联分析,以期找出与各类指标变化相关联的具体微生物物种及其基因这种研究思路,统称为全微生物组关联分析

以上就是我们精心整理的微生物组學问答集锦,希望能够成为大家开启微生物组研究的敲门砖!我们后续还将带来更多知识的梳理和分享敬请期待哦!任何疑问,都欢迎反馈至我们一定知无不言,言无不尽哦!

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