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第一次玩Postcrossing注册的时候在翻译地址上卡住了广西省玉林市玉州区新都香格里拉花园3栋二单元604翻译成英文能寄出去吗
提问者采纳
No. 40-1, Building 3, Unit 2.香格里拉;Street(看当地习惯选用)“广西省”., New Town Shangri-La Garden Estate，要译作Shangri-La, Yulin City, PRC, East Renming Road&#47, Yuzhou District，这样寄不出去哦~亲Postcrossing，交换明信片 中国广西壮族自治区玉林市玉州区人民东路40-1号新都香格里拉花园3栋二单元604Room 604., Guangxi Zhuang Autonomous Region
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wi ji bai ke
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3-2-604Shangrila GardenXin DuYu Zhou DistrictYu Lin CityGuangxiChina再加上邮政编码
广西省玉林市玉州区新都香格里拉花园3栋二单元604Room 604, Unit Two, Building 3, Xindu Xianggelila Garden, Yuzhou District, Yulin City, Guangxi Province
前面的用拼音。后面省市区什么的用英文。
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本帖最后由 cxrfly 于
14:36 编辑
一条核苷酸序列，如U1，它对应的翻译氨基酸序列具有53条(U1_1&&to U1_53)；如另外一条U2，对应的氨基酸序列有18条(U2_1 to U2_'18')。类似这样的核苷酸序列有2万条，对应的氨基酸序列在一个文件里。现在我想提取每条核苷酸对应的可能氨基酸翻译中最长的那条氨基酸序列及其ID号（即类似U1或者U2各自对应的最长氨基酸序列），如何实现阿？
菜鸟，刚学Perl，还不太会写脚本阿。求好心大侠是否帮我写一个？急阿~
&U1_1 [3 - 104]
VLDLFVAHHYIRRQRARHKIGQISHFWVITQLRI
&U1_2 [1 - 111]
KYSIFSLRIIIFEDSELATKSVRSAIFGSSLSFGSKK
&U1_3 [2 - 118]
STRSFRCASLYSKTASSPQNRSDQPFLGHHSASDLKSEA
&U1_4 [125 - 193]
SRRSTFELGLHPPWRTWNFGHQV
&U1_5 [108 - 215]
KVRRDDLAGRHSSWDCTLPGGHGILVIRFDEHMALL
&U1_6 [115 - 222]
GVMISQVDIRVGTAPSLEDMEFWSSGLMSTWLCSKK
&U1_7 [200 - 232]
AHGFALRNKRH
&U1_8 [219 - 314]
EINATDALVSEHEWFDVRVPDNNCAVAFNVSM
&U1_9 [226 - 330]
TPLTRSFPNMNGSMYAFQTITVRWPSTCRCKICCT
&U1_10 [287 - 364]
LCGGLQRVDVKSAARRTWPLCSPSRQ
&U1_11 [368 - 403]
IPSQNFLRLRRL
&U1_12 [318 - 536]
NLLHVERGRCVRHHVSEFQAKTFCDYVACSGFRALASVFIPVYPPCIASRTHVERQDMVV
EHFHAHTIHGITQ
&U1_13 [407 - 559]
WLQSFGLCIYSSVSTMHRQSHACRTARYGGRTLPCAYHSWHHAVGASGSSR
&U1_14 [334 - 606]
NVAVVFAITSVNSKPKLSAITSLVVASELWPLYLFQCIHHASPVARMSNGKIWWSNTSMR
IPFMASRSRGFWVISLIGTGLLVSTTTSAIR
&U1_15 [581 - 673]
FQPRLQQSDRSSPRQSTVRRRSALPSASDTQ
&U1_16 [677 - 718]
ESRYAVYEYFLPDT
&U1_17 [540 - 731]
GLLGHLVNRNGAVSFNHDFSNPIGVLHASRQFVEDQRCHLLQTPSRNLDTPCTSIFSQIH
&U1_18 [722 - 826]
YPVVTGVGTAIFSGLGQLASPFHNPSSNAYFPARP
&U1_19 [610 - 843]
EFSTPVDSSSKISAAICFRHPVGISIRRVRVFSPRYMISRCDGCRYSNFLRPWTTCISLS
QPFFKCIFSRSALSRCSS
&U1_20 [735 - 872]
RVSVQQFSQALDNLHLPFTTLLQMHIFPLGPESLFQLTNTHLLPHH
&U1_21 [847 - 894]
RIHTSFHTTDIPLDIV
&U1_22 [830 - 940]
VVVPADEYTPPSTPLTYRWTLYDTIGLSYVVASSCLG
&U1_23 [944 - 976]
FATASTSSRAL
&U1_24 [898 - 1038]
HDRSFLRRGFFLPRMICNCFNFISSSLTSSRNSISWKRRSFLALFGS
&U1_25 [980 - 1042]
LRPATRSVGSDVHFLPCSDRS
&U1_26 [1084 - 1152]
VSVFVTSGAFTHWNGVTGSSSVP
&U1_27 [876 - 1193]
HTAGHCMTRSVFLTSWLLLASDDLQLLQLHLELFDFVPQLDQLEATFISCLVRIVVEFLL
LELRLCRLMSQRIRHIWCIYPLEWGYRQQFRAIVSDIVVHCAQKHL
&U1_28 [1156 - 1194]
SPISSSIALRSTS
&U1_29 [1061 - 1195]
VEVVQTHESAYSSHLVHLPTGMGLQAAVPCHSLRYRRPLRSEAPP
&U1_30 [1180 - 1133] (REVERSE SENSE)
AQWTTISETMARNCCL
&U1_31 [1194 - 1081] (REVERSE SENSE)
GGASERNGRRYRRLWHGTAACNPIPVGKCTRCDEYADS
&U1_32 [1077 - 1018] (REVERSE SENSE)
VCTTSTQEEETQLRSEQGKK
&U1_33 [1084 - 1001] (REVERSE SENSE)
LMSLHNLNSRRRNSTTIRTRQEMNVASN
&U1_34 [997 - 965] (REVERSE SENSE)
SSCGTKSKSSR
&U1_35 [1014 - 916] (REVERSE SENSE)
TSLPTDRVAGRSQRARDEVEAVANHPRQEEATT
&U1_36 [955 - 803] (REVERSE SENSE)
SSCKSSEARRSHDVRKTDRVIQCPAVCQWCGRRCVFVSWNNDSGPSGKICI
&U1_37 [912 - 790] (REVERSE SENSE)
ERPIVSYNVQRYVSGVEGGVYSSAGTTTQGRAGKYAFEEGL
&U1_38 [799 - 761] (REVERSE SENSE)
RRVVKGRCKLSKA
&U1_39 [757 - 665] (REVERSE SENSE)
ENCCTDTRHNGISCIWEKILVHGVSRFLLGV
&U1_40 [786 - 598] (REVERSE SENSE)
KGDASCPRPEKIAVPTPVTTGYHVSGRKYSYTAYRDSYWVSEADGSADLRRTVDWRGELL
&U1_41 [643 - 554] (REVERSE SENSE)
SSTNCRLAWRTPIGLLKSWLKLTAPFRLTR
&U1_42 [528 - 436] (REVERSE SENSE)
CHEWYAHGSVRPPYLAVRHACDWRCMVDTLE
&U1_43 [520 - 395] (REVERSE SENSE)
MVCAWKCSTTISCRSTCVRLAMHGGYTGINTEAKALKPLQAT
&U1_44 [411 - 364] (REVERSE SENSE)
SHYKRRNRRKFWLGIH
&U1_45 [391 - 359] (REVERSE SENSE)
SQKVLAWNSLT
&U1_46 [360 - 304] (REVERSE SENSE)
RDGEHNGHVLRAADFTSTR
&U1_47 [355 - 218] (REVERSE SENSE)
WRTQRPRSTCSRFYIDTLKATAQLLSGTRTSNHSCSETSASVAFIS
&U1_48 [300 - 190] (REVERSE SENSE)
RPPHSYCLERVHRTIHVRKRARQWRLFLRAKPCAHQT
&U1_49 [214 - 107] (REVERSE SENSE)
SKAMCSSNLMTKIPCPPGRVQSQLECRPARSSRLTF
&U1_50 [183 - 91] (REVERSE SENSE)
PKFHVLQGGCSPNSNVDLRDHHASLFRSEAE
&U1_51 [64 - 32] (REVERSE SENSE)
PILWRARCLRI
&U1_52 [1193 - 3] (REVERSE SENSE)
EVLLSAMDDDIGDYGTELLPVTPFQWVNAPDVTNTLTHESAQPQLKKKKLNYDPNKARNE
RRFQLIELRDEVKELEMKLKQLQIIRGKKKPRRKKDRSCHTMSSGMSVVWKEVCIRQLEQ
RLRAERENMHLKKGCEREMQVVQGLRKLLYRHPSQRDIMYLGENTRTRRIEIPTGCLKQM
AALIFDELSTGVENSYRIAEVVVETNSPVPINEMTQKPLLRDAMNGMRMEVFDHHILPFD
MRATGDAWWIHWNKYRGQSSEATTSDVIAESFGLEFTDVMANTTATFYVQQILHRHVEGH
RTVIVWNAYIEPFMFGNERVSGVYFLEQSHVLIKPDDQNSMSSREGAVPTRMSTCEIITP
HFLDPKLSDDPKMADLTDFVASSLSSNIMMRNEKIEY
&U1_53 [69 - 1] (REVERSE SENSE)
SDRFCGELAVFEYNDAQRKDRVL
&U2_1 [2 - 52]
FTEPTSIDELLASRFPQ
&U2_2 [3 - 56]
LQSQLLSMSSSHHVSLNK
&U2_3 [56 - 154]
ISTSAGSMYFRAKCSPFRVGCAKATRFLFTCMP
&U2_4 [28 - 159]
APRITFPSINKHLGWFHVFSRKVQPISCRLREGNEVLVHMHAVN
&U2_5 [163 - 213]
LFAHDGHHSGRNAFPAE
&U2_6 [60 - 245]
APRLVPCIFAQSAAHFVSAARRQRGSCSHACRKLTFRARRPPFGSQCFSCGMRGAPKSGR
&U2_7 [217 - 258]
GVHPNLADANNGGF
&U2_8 [249 - 356]
RRVLNRQTQSQHHSQLRRSPRPSSTAQSSSKWSCPE
&U2_9 [158 - 400]
IDFSRTTATIRVAMLFLRNEGCTQIWQMPITAGFESADAVTAPFAATEVSASEFDCTIQF
EVVLSRVKASVMRSVLTHPTT
&U2_10 [262 - 441]
IGRRSHSTIRSYGGLRVRVRLHNPVRSGLVQSKGFRDALRIDTSNDLMVLNVDKVAALQK
&U2_11 [387 - 443]
HIQRLDGPECRQSGCAAET
&U2_12 [443 - 297] (REVERSE SENSE)
RFCSAATLSTFRTIKSLDVSIRSASRKPLLWTRPLRTGLCSRTRTRRPP
&U2_13 [275 - 144] (REVERSE SENSE)
LRLPIQNPPLLASARFGCTPHSAGKALRPEWWPSCAKSQFTACM
&U2_14 [441 - 52] (REVERSE SENSE)
FLQRSHFVYIQDHQVVGCVNTERITEAFTLDKTTSNWIVQSNSDAETSVAANGAVTASAD
SKPAVIGICQIWVHPSFRRKSIATRMVAVVREKSIYGMHVNKNLVAFAQPTRNGLHFARK
YMEPAEVLIY
&U2_15 [442 - 41] (REVERSE SENSE)
VSAAQPLCLHSGPSSRWMCQYGAHHGSLYSGQDHFELDCAVELGRGDLRSCEWCCDCVCR
FKTRRYWHLPDLGAPLIPQEKHCDPNGGRRARKVNLRHACEQEPRCLRAADTKWAALCAK
IHGTSRGAYLLRET
&U2_16 [140 - 21] (REVERSE SENSE)
TRTSLPSRSRHEMGCTLRENTWNQPRCLFIEGNVMRGAHR
&U2_17 [37 - 2] (REVERSE SENSE)
CEELIDRSWLCK
&U2_18 [48 - 1] (REVERSE SENSE)
GKRDARSSSIEVGSVN
&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp
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不懂生物，看不懂
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yestreenstars
& & 会写脚本就可以了，大侠留步
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你这些是一个序列相关的在一个文件里，还是全部都在一起？
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看不懂你的需求
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本帖最后由 iamlimeng 于
08:40 编辑
今后请楼主自己先写代码再来问，不要总是伸手，那样永远不会有提高！
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& & 所有2万多个核苷酸序列对应的所有氨基酸翻译都在一个文件（即一个氨基酸序列文件），想从这个文件里取出每个核苷酸对应的最长的氨基酸序列。
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& & 大侠，我错了，回头努力提高自己。这次比较急切
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#!/usr/bin/perl
use Bio::SeqIO;
my $file=shift @ARGV or die &Usage:\t$0\tseq_file\n&;
my $SeqIO=Bio::SeqIO-&new(-file=&&$file&,-format=&&fasta&) or die &Open seq_file failed!\n&;
my ($flag,$length,%ids,@out)=();
while(my $seq=$SeqIO-&next_seq()){
& & & & (my $id= $seq-&id)=~s/\_[\s\S]+$//;
& & & & my $tag=$seq-&
& & & & my $len=$seq-&
& & & & if(! $ids{$id}){
& & & & & & & & $ids{$id}++;
& & & & & & & & if($length and $flag){
& & & & & & & & & & & & my $pos=$flag.&\t&.$
& & & & & & & & & & & & push @out,$
& & & & & & & & }
& & & & & & & & $length=$
& & & & & & & & $flag=$
& & & & }else{
& & & & & & & & if($length&$len){
& & & & & & & & & & & & $length=$
& & & & & & & & & & & & $flag=$
& & & & & & & & }
& & & & }
}
my $pos=$flag.&\t&.$
push @out,$
while(my $pos=shift @out){
& & & & print $pos,&\n&;
}复制代码
15:25 上传
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& & 能否一起把对应的氨基酸序列和ID一起生成一个文件阿？谢谢
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