如何读基因序列,设计m13引物序列时的保守区指那...

关注今日:2 | 主题:272029
微信扫一扫
扫一扫,下载丁香园 App
即送15丁当
【求助】设计引物时的基因保守序列
页码直达:
这个帖子发布于6年零183天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
设计引物时要求在基因保守区内设计,保守区是指什么?是基因的蛋白翻译区还是转录区呢?请高手指点下,谢谢!!
不知道邀请谁?试试他们
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
我们所理解的保守区就是指mRNA外显子上的编码序列,也就是你说的蛋白翻译区。
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
应该是指 相关物种中 同源基因 蛋白氨基酸序列中的保守区先找到 同源基因的 蛋白氨基酸序列,比对,找到高度同源区域,再回到cDNA序列设计引物
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
哦,怎么找到高度同源序列呢?我用DNAMAN比对了大鼠、恒河猴、欧洲牛、小家鼠、智人的目标基因,出来的一致性(idendity)是39.90﹪,并且图示上一致的核苷酸很分散,没有连成片的区域,也就是保守区找不到了,怎么设计引物啊??DNAMAN分析结果如附件图片所示,怎么办呢?
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
请比对大鼠、恒河猴、欧洲牛、小家鼠、智人的目标基因 的蛋白氨基酸序列(不是DNA序列,用软件翻译或上网查)
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
sunfound edited on
哦,谢谢,万分感激!
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
氨基酸序列已经比对完毕,如附件所示,下一步怎么操作呢?一致的区域分好几段,选那段好些?现在是氨基酸序列,怎么变成核苷酸序列呢?有什么软件吗?
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
哦,明白了,要回到cDNA序列才行,现在是氨基酸序列,如何才能回到cDNA序列呢,用什么软件呢?
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
pp5是primer primer5.0吗?我试试看,谢谢回答
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
用primer primer5.0把蛋白序列翻译成DNA序列后,碱基怎么不是ATGC呢,还有R、Y、N、S、W等碱基呢?如图示:请高手解答下,谢谢
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
呵呵,回到cDNA的意思是,找到翻译那段高度同源蛋白的 cDNA序列(就是到原始cDNA序列里去搜索) 推荐用Vector NTI 功能比较全。不知道,你实验的目的是什么?
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
哦,用Real-timePCR 检测两个基因的表达情况,谢谢您的回答,我用Vector NTI 试试看!
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
关于丁香园您所在位置: &
&nbsp&&nbsp&nbsp&&nbsp
以16S-23SrDNA间区序列为目的基因设计PCR引物鉴定多杀巴斯德氏菌.pdf6页
本文档一共被下载:
次 ,您可全文免费在线阅读后下载本文档。
文档加载中...广告还剩秒
需要金币:80 &&
以16S-23SrDNA间区序列为目的基因设计PCR引物鉴定多杀巴斯德氏菌.pdf
你可能关注的文档:
··········
··········
第 41卷 第 2期 南 开 大 学 学 报
自然科学版 Vo1.41 N92 2008年 4月 ActaScientiarum Naturalium UniversitatisNankaiensis Apr.2008
ArticleID : 07―06 DesigningPCR Primersfrom 16S-23SrDNA IntergenicSpacerRegionfortheIdentification ofPasteurellamultocida Zh0uHa0,LiuYin,ChenYijun,ZhengZejun,HuangXitai CollegeofLireSciences,NankaiUniversity,Tianjin300071,China Abstract:Pasteurellamultocida isan importantpathogen thatinfectsmanykindsofanimals.Inpresent study,apolymerasechainreaction
PCR assayusingprimersderivedfrom the16S一23SrRNA intergenicspacer ITS ofP.multocidawasdeveloped.OnepairsofspecificPCR primersweredesignedbysequencingtheITS― IA
ITScontainingtDNA―neandtDNA―Ala ofP.multocidaandBLAST ofGenBank.Thespecificityandeffi― ciencydfthePCR methodsweretestedagainstapane1ofnumerousstrainsfrom 39differentbacteria1strains. AlloftheP.multocidastrainsgeneratedpositivesignal,andnocross―reactionwasobservedwithnon―P.multo― cidastrainsinthePCRdetection.Sensitivityofthedetectionis100CFU/mLcultures.Thenewlydeveloped PCR arrayprocedurestakeonly20hoursforeachtime.whereastheconventiona1methodsrequiredat1eastfive days.ThisstudydemonstratedthatthePCR detectionforP.multocida istime~savedandreliable. Keywords:Identification;ITS;Pasteurellamultocida;PCR CLCnumber:Q93―331 Documentcode:A 0 Introduction Pasteurellamultocidaisan importantpathogenthatinfectsmanykindsofanimalsandisanoppor~
tunistichuman pathogen[’.In pigs,P.multocidaiscommonlyassociatedwithatrophicrhinitis,pneu~
monia。and septicemicpasteurellosis
.In poultry。infectionwith P.multocidamayresultin fowl
cholera.P.multocidahasbeen extensively studiedsinceitwasfirstisolated in thelate1870s[ ].In
particular,Mutterseta1. 1985a performedan extensivestudyusingDNA homologyandrecognized
threesubspecieswithin P.multocida―― P.m
正在加载中,请稍后...大数量序列的PCR保守引物设计实践_图文_百度文库
两大类热门资源免费畅读
续费一年阅读会员,立省24元!
大数量序列的PCR保守引物设计实践
上传于||暂无简介
阅读已结束,如果下载本文需要使用0下载券
想免费下载更多文档?
下载文档到电脑,查找使用更方便
还剩1页未读,继续阅读
你可能喜欢设计实时定量PCR引物是根据基因的全长设计引物还是根据基因的开放阅读框设计引物?
你的real time PCR扩增的是cDNA啊,因此用CDS序列啊.
为您推荐:
其他类似问题
扫描下载二维码大数量序列的PCR保守引物设计实践_图文_百度文库
两大类热门资源免费畅读
续费一年阅读会员,立省24元!
大数量序列的PCR保守引物设计实践
上传于||文档简介
&&P​C​R​引​物​设​计​网​页​免​费​设​计
阅读已结束,如果下载本文需要使用0下载券
想免费下载更多文档?
下载文档到电脑,查找使用更方便
还剩1页未读,继续阅读
你可能喜欢

我要回帖

更多关于 m13引物序列 的文章

 

随机推荐