在结构生物学中,an apo formm是什么意思

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人体内转录因子Sry-related Box 17 结合DNA反应机理的结构生物学研究(可编辑)【大学毕业论文】.doc112页
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人体内转录因子Sry-related Box 17 结合DNA反应机理的结构生物学研究
中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京 100193
摘要Sry-related Box
是一类含有一个 HMG 结构域的转录因子HMG 结构域结
合 DNA 后使 DNA 发生弯曲从而达到调控遗传信息转录的效果在器官分化期各个 Sox 成
员在不同的细胞系中具有不同的转录调控功能表明每种 Sox 转录因子具有其独特的与
DNA 相互作用的机理研究每种 Sox 转录因子的 HMG 结构域与 DNA 结合前后空间结构变
化可以为阐明 Sox 转录因子各自不同的 DNA 结合机理提供分子结构证据之前的研究报道
了 Sox2Sox4Sox9Sox17 的 HMG 结构域与 DNA 复合体的晶体结构但缺乏测定对应
的 HMG 结构域单体的晶体结构来证明 DNA 结合后 HMG 结构域的空间结构变化为了填
补这些对自然现象理解的不足之处本研究测定了 24
分辨率 Sox17 的 HMG 结构域的晶
体结构从分子结构层面阐明了 Sox17 与 DNA 的相互作用机理
关键词转录因子Sry-related Box 17
Sox17 HMG 结构域DNA 结合晶体结构
中图分类号Q512
Structure Biological Investigation of Human Transcription
Factor Sry-related Box 17 Binding to DNA
REN Jixia XIE Yong
Institute of Medicinal Plant Development Chinese Academy of Medical Science
Peking Union
Medical College Beijing 100193
Abstract Sry-related box
transcription factors share a conserved high-mobility-group box
HMG-domain
that binds DNA and bends DNA for further assembly of transcriptional
machineries During organogenesis each member of the Sox family triggers a specific cell lineage
differentiation indicating that their interactions with DNA are different from each other
Investigating structural rearrangement of each Sox transcription factor HMG-domain upon
binding to DNA would help to elucidate the distinctive
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鱼腥蓝细菌异形细胞分化调控关键蛋白质的结构与调节机制分析.pdf105页
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中国科学技术大学
博士学位论文
鱼腥蓝细菌异形细胞分化调控关键蛋白质的结构与调节机制研
姓名:赵梦溪
申请学位级别:博士
专业:生物化学与分子生物学
指导教师:周丛照;陈宇星
蓝细菌,又称蓝绿藻,是一种可以进行光合作用的原核生物。一些蓝细菌,
如丝状蓝细菌鱼腥蓝细菌,还可以进行固氮作用。鱼腥蓝细菌生长在淡水环境中,
在营养丰盛的条件下,藻丝中细胞以营养细胞形式存在。当环境中的化合态氮源
缺乏时,会沿藻丝以每 10 个营养细胞为间隔分裂出可以进行固氮作用的异形细
胞,将氮气固定为化合态的氮源,并传输给临近的营养细胞,从而帮助整个藻丝
渡过氮源匮乏的时期。因此,鱼腥蓝细菌是作为研究细胞分化良好的模式生物。
2-酮戊二酸(2-oxogluatarate, 2-OG),
来自高度保守的三羧酸循环途径,不
仅是一个关键的代谢产物,同时也在许多细菌、植物甚至高等动物中,作为一种
信号分子。在蓝细菌中,2-OG 被证明是蓝细菌氮源缺乏的信号分子。而全局转
录因子NtcA 与信号传导蛋白被认为是2-OG 的感应蛋白。NtcA 属于Crp-Fnr 转
录因子家族,其典型的成员是结合cAMP 的CAP 蛋白。我们解析了鱼腥蓝细菌
PCC 7120 中NtcA 的apo-form(1.90 ?)、结合2-OG(2.60 ?)和结合2-OG 的
不可代谢类似物―2,2-二氟代戊二酸(2.40
?)的三个结构。三个结构都是同源
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09-09-15 &匿名提问
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