采用分水岭分割方法获取功能磁共振激活图感兴趣区--《中国医学影像技术》2008年09期
采用分水岭分割方法获取功能磁共振激活图感兴趣区
【摘要】：目的为功能磁共振中的功能连接研究提供一种更为合适的感兴趣区(ROI)获取方法。方法20名正常被试者完成视觉任务扫描,对视觉任务组水平激活图利用分水岭算法进行功能分割。结果分水岭方法可得到单峰的、空间上互相独立的激活区。结论分水岭方法可以将较大的、有多个激活峰值的功能团块分割为空间上相互独立的单峰脑区,克服了单纯采用激活程度阈值来产生ROI的方法之缺点,为下一步的功能连接分析提供了一种选择ROI的方法。
【作者单位】：
【关键词】：
【分类号】：R318【正文快照】：
在功能磁共振(functional magnetic resonance imaging,fMRI)的研究中,脑区间的功能连接(functional connectivity,FC)一直都是人们广泛研究的焦点[1-4]。功能连接被定义为“度量不同脑区之间时间相关性的神经生理学指数[5]”。在FC的研究中,一个重要的问题就是选取感兴趣区域
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通常我们得到的脑功能激活图都是一大片，额叶、枕叶、顶叶、颞叶可能都会有，现在我只想看某一个感兴趣区的激活（例如颞叶），请问我应该怎么取这部分激活呢？
之前我用MRICRON在激活图上画了一个感兴趣区（颞叶某个区域）VOI，然后将VOI和OVERLAY的激活图求交集，得到只是与VOI激活面积大小一致的一个区域而已，没有我想要的激活强弱变化的一个区域。。。。
有高手提示我要在SPM里面用IMCALC计算激活与感兴趣区求余，本人研究了一下还是不太会弄，请问应该如何拿我画的VOI和激活图求我要的感兴趣区激活呢？最好能详尽些，呵呵~~
在此先谢过支持本帖的滴友们^_^
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水晶4394 心级469 精华0主题帖子
自己画的VOI里面, 要的voxel值为1，不要的voxel值为0，
把这个准备好的VOI与OVERLAY voxel-wise 相乘即可。不要用激活图求交集，那是logical AND, 你只需要简单相乘。
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如果仅仅为了呈现的目的要取一个独立的激活区出来，用ps或画图 mask掉其它脑区的激活也行
惠皆施来者，来者皆施惠。 诚信与朋友是人生最大的资产。
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我个人觉得这样做太可怕了，没想到还有这么多人热心支招。难怪咱们中国的科学家的声望不好，这不是典型的学术造假吗？
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先回复楼上那位的观点，我们的意图不是为了造假，事实上我们是拿的是真家伙，只不过目的是为了凸显我们感兴趣的东西来说事，那些不太感兴趣的和解释不了的就一笔带过了。很多国外研究者在讨论的部分也是给的这样的图，我们只是想学别人的这种方法而已……
至于PS的做法确实有点……
所以我在此才在此请教，很郑重地要问一个行内认同的科学的做法~~请不要曲解我的本意
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水晶300 心级110 精华0主题帖子
另外实践了一下kitten的方法，弱弱地问一句是不是在SPM5里面将VOI转化为NII格式的文件与原激活写成i1*i2这样啊？？
怎么MATLAB提示Can't evaluate呢？？？
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水晶4394 心级469 精华0主题帖子
如果这是很正常的ROI analysis/discussion, 那和造假没有关系
造假是把“有”说成“没有”，或者“没有”说成“有”. ROI analysis 只管ROI里面的事情，不管（不研究，不讨论）其外面“有”还是“没有”。
我很少用SPM, 只晓得该怎么做但不清楚具体的命令, Wonder 应当比我熟。
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如水 如风 如金 如火 如木 如雷
水晶1061173 心级808 精华0主题帖子
确实和造假谈不上，不过如果你的功能激活是连成一片的，那你得有充足的理论或支持证据来说明你为什么要选那一块作为你的ROI
漫漫晨曦远，冷冷立身清。
独行辅仁笑，谐伴木铎声。
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