核磁图谱 Mestre-c 处理分析_百度文库
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核磁图谱 Mestre-c 处理分析
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关于丁香园第29卷第2期2010年2月；实验室研究与探索；RESEARCHANDEXPLORATIONIN；Vo.l29No.2；Feb.2010；利用MestRe-C软件处理二维核磁共振谱图；赵辉鹏,查刘生；(东华大学分析测试中心,上海201620)；摘要:针对Bruker公司产的核磁共振谱仪上采集；调用一维谱图、数据输出等一系列主要步骤；中图分类号:O482.53
第29卷第2期 2010年2月
实验室研究与探索
RESEARCHANDEXPLORATIONINLABORATORY
Vo.l29No.2
利用MestRe-C软件处理二维核磁共振谱图
赵辉鹏, 查刘生
(东华大学分析测试中心,上海201620)
摘 要:针对Bruker公司产的核磁共振谱仪上采集的数据,报道了利用MestRe-C软件处理二维核磁共振(2DNMR)谱图的方法,包括数据的导入和变换、相位较正、基线校正、化学位移定标、在二维谱图上
调用一维谱图、数据输出等一系列主要步骤。关键词:核磁共振波谱;二维核磁共振波谱图;MestRe-C软件
中图分类号:O482.53
文献标识码:A
文章编号:10)02-0044-03
Processing2DNMRDatabyMestRe-CSofeware
ZHAOHui-peng, ZHALiu-sheng
(ResearchCenterforAnalysisandMeasuremen,tDonghuaUniversity,Shanghai201620,China)
Abstract:Theprocessmethodoftwodimensionalnuclearmagneticresonance(NMR)datausingMestRe-Csoftwarewasintroduced,mainlyforNMRdataacquiredonBrukerNMRspectrometer.Theprocedureincludesdataimportandtransformation,phasecorrection,baselinecorrection,chemicalshiftreference,setup1Dtracesanddataexpor,tetc.Keywords:nuclearmagneticresonance(NMR);twodimensionalNMRMestRe-Csoftware
从1945年Purcell等
处理方法的详细介绍则比较少,因此,有必要对Me-stRe-C处理二维NMR谱的步骤、方法和技巧进行介
成功地观察到固体蜡和
绍,以期对广大科研工作者提供参考。
本文中所用MestRe-C软件的版本为4.9.9.6,所用到的核磁共振数据在BrukerAV400谱仪上采集。
水中质子的核磁共振吸收现象至今,核磁共振(NMR)
技术已有近70年的发展史。在此期间,NMR取得了飞速发展,借助计算机和软件的快速进展
多维核磁共振的应用范围,二维核磁共振已经成为常规的测试手段,在有机化学、生物化学、药物化学、高分
子材料等领域得到了广泛应用。如何将得到的NMR数据转化成符合特定需要的图谱,对广大科研工作者有着重要意义。
处理核磁数据的软件有MestRe-C,nuts,SwaN-MR
2 MestRe-C处理2DNMR数据
2.1 2DNMR数据导入和变换
2DNMR数据的导入通常有2种方法:1直接导入处理好的谱图,利用File菜单中的open命令打开数据中的2rr文件,即可得到已经处理好的谱图,如图1所示。o导入2DFID,再进傅里叶变换。利用file菜单中的importspectra命令或者快捷键中
,NMRLAB等。其中MestRe-C软件是目前处
理核磁数据用得最多的软件之一。该软件可从h-ttp://www.网站免费下载。对于利用
MestRe-C软件处理一维核磁共振数据的方法,在专业论坛上都有比较详细的介绍,而对于二维NMR谱的
作者简介:赵辉鹏(1979-),女,河南汝阳人,助理研究员,从事核磁共振在高分子结构中的应用研究。
Te.E-m:lhpzhao@dhu.edu.开数据文件夹中的ser文件,得到图2所示的二维谱图的FID,再点击2次快捷键中的FT或单击process菜单中的相应命令,分别设置合适的采样点数(即
size),进行2次傅里叶变换,即可得到同图1一样的谱图。也可利用fullFT快捷键或单击process菜单中的相应命令,得到图3的对话框,分别点击alongF2和alongF1后面的
按钮,设置相应的采样点数和
赵辉鹏,等:利用MestRe-C软件处理二维核磁共振谱图
于所用的脉冲序列。通常做的NOESY、TOCSY、HSQC
是相敏的二维谱,而COSY和HMBC则不是。
MestRe-C只对导入2DFID进行傅里叶变换的相敏谱进行相位校正。对于2DNMR谱的相位校正可以用自动和手动2种,可以用快捷键中的
进行自动和手动相位校正,也可以利用process菜单中的相同命令。与MestRe-C处理1DNMR谱的方法不同的地方在于手动调节时要同时对f1维和f2维进行校正(见图4),分别点击f1和f2图标,通过滚动鼠标中键调节谱图的相位。另外,也可以用2Dphasingwith1D-Slices命令通过调节其中的1D谱的相位来校正。图5为相位校正前、后的HSQC谱图,可以看出,相位校正后谱图分辨率明显提高。
图1 直接打开的2DNMR
图2 打开的2DF
图3 FullFT
图5 HSQCNMR谱图
2.3 基线校正及化学位移定标
基线校正的方法与1D基本相同,可以利用process菜单中的baseline命令或者点击快捷键中的
中的箭头,选择FullAuto或者BaselineCorrec-图4 相位校正对话框
tion,在BaselineCorrection对话框中选择F1、F2分别对F1和F2维进行校正,也可以利用F1+F2同时进行2D基线校正。
2D谱的化学位移定标与1D的方法相同,点击快捷键或者选择Tools菜单中的reference命
令在设定化学位移时同时设置F1、F2维的参考值
2.2 相位校正
对于1DNMR谱图,均需进行相位校正得到纯吸
收线型的谱,而2DNMR谱图则分相敏谱和绝对值谱2种,只有相敏的2DNMR谱需要做相位校正。最常用的2DNMR谱有NOESY、TOCSY、HSQC、COSY、HM-
实 验 室 研 究 与 探 索
2.4 在二维谱上调用一维谱图
2DNMR谱图在归属时需要和相应的一维谱图相对照,因此,在2DNMR谱的两侧通常会做出相应的一维NMR谱图,这在MestRe-C中也能得到实现。选择Tools工具栏中的setup1Dtraces,或者窗口左边的
快捷键,在跳出的对话框中分别选择对应的F1和F2维的一维谱图,即可得到如图6所示的同时显示2D和1D的谱图。通过点击箭头,可以得到
键中的调节坐
word中要调用已经处理好的2DNMR谱图,可以直接
利用Edit菜单中的copy命令,如果选择copymatafiletoclipboard,再粘贴到文档中,此时得到的谱图没有原图背景,本文中的2D谱图均为该种方式处理的结果。如果选择copybitmapclipboard命令,则会得到有原图背景的谱图。
MestRe-C是一款功能强大的核磁共振数据处理软件,本文只对利用MestRe-C处理2D谱图的方法和步骤做简单介绍,在科研工作中处理NMR数据得到符合要求的谱图还需使用者在使用过程中逐渐摸索和熟练,希望本工作能够给大家起到参考作用。参考文献(References):
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[4] 宁永成.有机化合物结构鉴定与有机波谱学[M].2版.北京:科
学出版社,.
[5] CobasJC,SardinaFJ.Nuclearmagneticresonancedataprocessing.
MestRe-C:Asoftwarepackagefordesktopcomputers[J].ConceptsinMagneticResonancePartA,):80-96.
分别用于调节水平和垂直方向的一维谱图的高度和与
二维谱之间的距离。这是一种可见即所得的调节,能
够满足不同的特定需求。
图6 MestRe-C处理后输出的2DNMR谱图
[6] CobasJC,Constantino-CastilloV,Martin-PastorM,etal.Atwo-stageapproachtoautomaticdeterminationof1HNMRcouplingcon-stants[J].MagneticResonanceinChemistry,):843-848.
[7] BalaccoG,AcompleteandexpansibleNMRsoftwareforthemacin-tosh[J].JChemInfComputSc,i5-1241.
[8] BalaccoG.SwaN-MR:Frominfancytomaturity[J].MolBiolTo-day,-28.
[9] GuntherU,LudwigC,RuterjansH.NMRLAB)advancedNMRdata
processinginmatlab[J].JMagnReson,-208.
2.5 输出设置和输出
对于通过傅里叶变换、相位校正、基线校正等处理后得到的谱图,仍需进行谱线粗细、坐标轴字体大小等
调节,这些均可通过点击鼠标右键选择Properties的方法进行调整,以得到清晰、符合需要的谱图。
在处理过程中可以通过File菜单中的save或saveas命令对所做的处理进行保存。在其他文档如
(上接第36页)
的创新思维将起到积极的作用。参考文献(References):
[1] 漆安慎,杜婵英.普通物理学教程:力学[M].北京:高等教育出
[2] 杨述武.普通物理实验(一)[M].北京:高等教育出版社,2007:
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[7] 何松林,戴祖诚,黄 焱.弱阻尼非线性单摆的周期研究[J].大
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[8] 罗均华,王新兴.影响单摆振动周期因素的研究[J].河西学院学
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(6):12-15.
[10] 赵凯华,罗蔚茵.新概念物理教程:力学[M].北京:高等教育出
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　含磷化合物核磁共振谱图的应用_电力/水利_工程科技_...13C核磁共振波谱及谱图解... 33页 免费 第十二章...©2014 Baidu 使用百度前必读 | 文库协议... 　13C 谱、二维核 磁共振谱等高级谱图,核磁共振技术解析分子结构的能力也越来越...由于绝大多数聚 合物是在固态下使用,因此,研究聚合物的结构及其结构在处理过程... 　可利用可靠的甲基信号或孤立的次甲基信号为标准计算...4.先解析图中 CH3O、CH3N、 、CH3C=O、CH3C=C...可考虑测试二维核磁共振谱配合 10. 如果一维1H-NMR... 　核磁谱图已经从过去的一维谱图( 1D )发展到如今 的二维( 2D )、三维( 3D ...实验样品核磁共振氢谱图 所做的实验数据用 MestReNova 软件打开处理,积分出峰... 　2.Varian300MHz 核磁共振波谱仪的操作程序 (1)打开...4.先解析图中 CH3O、CH3N、 、CH3C=O、CH3C=C...难以解析分子结构, 可考虑测试二维核磁共振谱配合解析... 　第四章 二维核磁共振谱_理学_高等教育_教育专区。有...1H-13C CCOSY 强调小的偶合常数,压制大的偶合...图 4.7 典型 2-丁烯酸乙酯 COSY 谱图 图 4。6... 　核磁数据处理软件有: Nuts、 MestRe-C、 Gifa, NMRNoteBook, Sparky, NMRpipe ...看谱图 : cp (contour) 或 ip 输入命令 ru,选择相应二维宏命令 选择二维... 　以及后来的二维核磁共振光谱(2D-NMR) ,从 测量 1H 到 13C、31P、15N,从...六、谱图的应用 1.定性:推断分子结构 2.定量 :例正丙苯、异丙苯混合物 §4... 　6.CH3CH2COOH 在核磁共振波谱图上有几组峰?最低场信号有几个氢?( ) A.3(1H); B.6(1H); C.3(3H); D.6(2H)。 7.下面化合物中在核磁共振谱中...MestReNova 5.2 一维核磁谱图数据处理软件 MAC下载 苹果下载正式版 注册版 破解版 MACOSX 苹果专卖店 苹果在线
> MestReNova 5.2 一维核磁谱图数据处理软件
MestReNova 5.2 一维核磁谱图数据处理软件MestReNova for mac 5.2介绍
MestRe Nova是一款非常强大的一维核磁谱图数据处理软件。
它是继Mestrec之后Mestrelab Research SL公司推出的又一主打产品，应用于核磁及GC/LC-MS数据的处理分析、预测、发表及数据的储存、检索以及管理等功能，具有功能强大健全、操作简便人性化、处理结果准确美观等优势。
MestReNova主要由NMR、MS、NMRPredict Desktop、DB四个部分组成。
Mnova NMR功能简介
1. 兼容性好
可以处理Bruker、Varian、JEOL、Gemini、Siemens、Nuts等核磁数据
2. 类PPT操作界面
同一窗口可浏览并处理多张谱图，提高工作效率
3. 导出数据专业化
可以按照国外著名期刊要求格式导出数据，数据可直接用于文章的发表或论文的写作
4. 化学结构自动验证（ASV）
5. 自动归属1D和2D核磁数据，并可导出数据列表用于文章和论文的写作
6. GSD:自动谱峰拟合及多谱图定量分析
7. 谱图叠加处理及代谢谱图批处理分析功能
8. 差谱处理功能
9. 另外还具有脚本撰写、自动排版、直接导入化学结构、谱图注释标记等功能
Mnova MS 功能简介
1. 兼容性强。
2. 根据质谱数据进行元素组成分析。
3. 化合物结构吻合验证
NMRPredict Desktop功能简介
1. 根据化合物结构预测1H、13C及杂原子F、 O、N、P、Si、B谱等
2. 综合考虑化合物立体构型对核磁信号的影响，使预测结果更加准确可靠
DB（Database）功能简介
1. 可以对实验数据（NMR及MS）储存、检索及管理
2. 根据储存信息更准确的解析新的化合物结构
NMRPredict Full功能简介
1.&&数据库包括天然产物及其他有机分子（1-99个碳）近百万张核磁谱图
2.&&可以通过核磁谱图检索相关结构，并可追踪至文献数据
3.&&可通过结构或子结构(或分子量, 作者等)检索有关核磁数据及文献数据
4.&&允许自行建立并储存自己的核磁数据，并可简便检索，非常适合于复杂分子的结构解析
软件下载重要说明:
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