利福平耐药基因数据库RPOB什么意义

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& & 结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB),简称结核杆菌,是人类历史上最“悠久”,对人类威胁最大的病原体之一,是结核病的元凶,可累及全身多个器官,以肺结核最为常见。据世界卫生组织报道,全球有活动性肺结核病人约2000万,每年新发结核病人约800-1000万,约有300万人死于结核病,且80%以上的患者都是15~49岁的青、壮...
& & 结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB),简称结核杆菌,是人类历史上最“悠久”,对人类威胁最大的病原体之一,是结核病的元凶,可累及全身多个器官,以肺结核最为常见。据世界卫生组织报道,全球有活动性肺结核病人约2000万,每年新发结核病人约800-1000万,约有300万人死于结核病,且80%以上的患者都是15~49岁的青、壮年。
& & 利福平(rifampicin,RFP),其化学名为3-[[(4-甲基-1-哌嗪基)亚氨基]甲基]-利福霉素,分子式为C43H58N4O12,分子量为822.95(图1)。利福平是利福霉素的半合成衍生物,通过与细菌RNA聚合酶β亚基结合,干扰细菌的转录过程,实现杀菌效果。
& && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && && &图1 利福平化学结构式
& & rpoB基因是细菌RNA聚合酶β亚基的编码基因,为单拷贝基因,序列高度保守。结核分枝杆菌的rpoB基因全长3,519bp。rpoB基因突变一般是单个碱基突变或数个碱基联合突变,主要集中在507-533密码子位点的81bp核心区域,即RFP的耐药决定区(RRDR),因而可以通过分析菌株的基因型来判断细菌对RFP的敏感性。
利福平的作用机理
& & 利福平(RFP)通过与细菌RNA聚合酶β亚基(rpoB)结合,干扰细菌的转录过程,实现杀菌效果。rpoB基因核心区域发生突变时,利福平不能与RNA聚合酶β亚基结合,导致细菌对利福平耐受。遗传互补法证实了rpoB突变与耐利福平间的因果关系,即将突变的rpoB基因借助结核分枝杆菌穿梭质粒导入对利福平敏感的耻垢分枝杆菌LR222后,该菌出现了高度耐利福平。突变一般集中在rpoB的507-533位27个氨基酸密码子81 bp组成的高度保守区域(RRDR)内,95%左右的RFP耐药菌株都包含了这一区域的突变。rpoB基因突变已作为MTB耐RFP的遗传标志,其中以531位Ser→Leu突变最常见,因此可以把检测这个区域的突变作为一种检测结核杆菌耐RFP简易、快速的方法,通过对rpoB突变的检测可以判断细菌对利福平的敏感性。另外由于异烟肼和利福平是临床最常用的药物,有作者报告90%-95%耐利福平株同时也耐异烟肼,因而单独进行利福平敏感性分析也可作为耐多药的筛选指标[1-3]。
转化医学核心门户 下载转网精华,了解更多资讯新疆部分地区结核分枝杆菌rpoB基因突变与对利福平耐药相关性检测--《中国当代医药》2010年33期
新疆部分地区结核分枝杆菌rpoB基因突变与对利福平耐药相关性检测
【摘要】:目的:了解新疆部分地区结核分枝杆菌rpoB基因的突变与对利福平耐药呈水平的关系。方法:采用基因芯片对耐利福平菌株rpoB基因进行检测。结果:36株结核分枝杆菌利福平初始耐药分离株,对利福平高度耐药25株,低度耐药11株。基因芯片检测显示33株存在突变,低度耐药株突变主要在526位,少数在531位;高度耐药株突变主要在526位、531位,其中3株未见突变,3株为526和516位联合突变。结论:本地区结核分枝杆菌对RFP的低度耐药表现为rpoB基因的点突变,而高度耐药则表现为rpoB基因的526位、531位点突变及联合突变形式。
【作者单位】:
【关键词】:
【基金】:
【分类号】:R440【正文快照】:
结核分枝杆菌耐药菌株的出现是结核病疫情再度复燃的重要原因。目前多数研究表明对利福平(RFP)的耐药与rpoB基因突变关系密切,已成为开发快速检测方法的重要指标,而有关耐药基因突变与耐药程度有否关联,国内外文献的报道不尽相同[1-2]。在对新疆和田地区的监测报告也显示多数
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京公网安备75号结核分支杆菌利福平耐药基因突变的研究--《中华结核和呼吸杂志》1998年06期
结核分支杆菌利福平耐药基因突变的研究
【摘要】:目的了解我国结核分支杆菌耐利福平(RFP)分离株rpoB基因突变情况,建立快速检测结核分支杆菌耐药基因型的分子药敏试验方法。方法通过聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和PCR-直接测序法(PCR-DS)分析50株结核分支杆菌临床分离株的rpoB基因。结果3株结核分支杆菌药物敏感株和2株非RFP耐药株中,仅1株rpoBSSCP图谱异常的药物敏感株出现531位密码子TCG→TTG突变。45株RFP耐药株中,10株SSCP和DS分析均未见rpoB突变,35株SSCP和DS分析异常,其中14株为531位密码子TCG→TTG或TGG或TAC突变,14株为526位CAC→TAC或GAC或CCC或CTC或GTC突变,2株为516位GAC→GTC或TAC突变,2株为516位和526位及515位和516位密码子双点突变,3株rpoB序列与结核分支杆菌不同。结论大多数结核分支杆菌耐RFP是由于其rpoB基因突变所致,采用PCR-SSCP和PCR-DS方法可快速测定结核分支杆菌RFP耐药基因型
【作者单位】:
【关键词】:
【分类号】:R378.911,【正文快照】:
结核分支杆菌利福平耐药基因突变的研究吴雪琼张俊仙庄玉辉张晓刚李国利何秀云张军芝贾树林【摘要】目的了解我国结核分支杆菌耐利福平(RFP)分离株rpoB基因突变情况,建立快速检测结核分支杆菌耐药基因型的分子药敏试验方法。方法通过聚合酶链反应-单链构象多态性
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