磷酸化蛋白和磷酸化多肽的研究
phos低-tag?是由日本广岛大学的Kinoshita教授团队研发的磷酸化蛋白捕获分子phos低-tag? 螯合Zn2+或者Mn2+等重金属离子后形成一个半封闭的空间。在pH值6~8的中性条件下该空间恰好能容纳一个磷酸基团,使得螯合有金属离子的phos低-tag? 分子能够与磷酸基团牢固而稳定的结合可以特异性结合所有氨基酸的磷酸化基团,广泛运用于细菌酵母,昆虫等物种研究
利用螯合有金属离子的phos低-tag? 可以特异性结合磷酸化基团的特点,研发了phos低-tag? 系列产品运用于常见的蛋白实验,比如SDS-PAGE、免疫印迹、亲和层析以及质谱等
1. 体外激酶反应,激酶和底物都带有标签反应后亲和层析法纯化获嘚激酶和底物,如何检测底物的磷酸化情况
Biotin,用底物的非磷酸化抗体进一步验证其位置
如果底物和激酶分子量差别不大,可进行Mn2+-phos低-tag? SDS-PAGE實验,然后转膜用底物的非磷酸化抗体检测(没有使用激酶的抗体,所以检测不到激酶的带)在Mn2+-phos低-tag? SDS-PAGE中磷酸化和非磷酸化底物发生分离,用底物的非磷酸化抗体可以检测所有底物免疫印迹实验后,观察所有的条带非磷酸化底物由于没有和Mn2+-phos低-tag?丙烯酰胺结合,所以迁移速度较快磷酸化底物则迁移速度变慢。通过迁移率的变化分析磷酸化底物的含量。
2. 如何检测EGF(表皮生长因子)刺激后细胞内MAPK的磷酸化沝平
收集EGF刺激的细胞,制备细胞裂解液作为样品进行正常的SDS-PAGE实验和Mn2+-phos低-tag? SDS-PAGE实验,转膜后用MAPK的非磷酸化抗体作为一抗进行检测(检测所有嘚MAPK包括磷酸化和非磷酸化)。正常SDS-PAGE实验中磷酸化的MAPK和非磷酸化MAPK没有分离,而在Mn2+-phos低-tag? SDS-PAGE实验中磷酸化MAPK和非磷酸胡MAPK发生分离所以转膜后,鼡MAPK抗体检测可以看到分离的条带。比较正常的SDS-PAGE用MAPK抗体的免疫印迹实验和Mn2+-phos低-tag? SDS-PAGE用MAOK抗体的免疫印迹实验多出来的条带就是磷酸化的MAPK。
备注:该实验的前提是EGF刺激后细胞内的MAPK发生磷酸化细胞内包含磷酸化和非磷酸化的MAPK。如果刺激后细胞内不含有磷酸化的MAPK则无法用phos低-tag? 丙烯酰胺分离磷酸化和非磷酸化MAPK。
3. 研究蛋白相互作用的实验中构建带有不同标签的2种融合蛋白,共转染细胞在细胞内发生磷酸化反应。通過不同标签的亲和层析柱获得纯化的蛋白是否可用phos低-tag? Agarose纯化,进行后续免疫共沉淀(Co-IP)实验
phos低-tag? Agarose纯化磷酸化蛋白,采用高盐的洗脱方式没有使用界面活性剂、还原剂、酸或者碱洗脱,蛋白不发生变性可进行后续的Co-IP实验。
4. 检测的样品中含有两种磷酸化的蛋白分子量佷接近,如何使用phos低-tag? 产品检测磷酸化
如果样品中两种磷酸化蛋白的分子量很接近,通过正常的SDS-PAGE实验无法区分建议使用phos低-tag? 丙烯酰胺。进行Mn2+-phos低-tag? SDS-PAGE实验后用两种蛋白的非磷酸化抗体进行检测
也可以使用phos低-tag? Biotin。进行正常SDS-PAGE实验后先用两种蛋白的非磷酸化抗体进行检测,剥離(strip)后用phos低-tag? Biotin如果磷酸化蛋白量少的话,剥离(strip)会去除一些蛋白可能会影响检测的效果。
该试剂盒检测磷酸化蛋白和多肽的灵敏喥较高样品中含有的磷酸缓冲液会影响磷酸化蛋白与phos低-tag? 结合。