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30个插入缺失多态性位点在中国广东汉族人群中的遗传多态性
Genetic Polymorphisms of 30 Indel Loci in Guangdong Han Population遗传,中国,位点,30个插入,缺失多态性,遗传多态性,China,多态性,汉族人群,广东省
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30个插入缺失多态性位点在中国广东汉族人群中的遗传多态性
Genetic Polymorphisms of 30 Indel Loci in Guangdong Han Population
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相关性分析中，bonferroni校正的问题
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问题已解决悬赏丁当:20
各位老师，请教相关性分析中，bonferroni校正的问题。
我的课题中，在病人组（38人）和对照组（20人）中，对一些实验室指标进行了相关性分析，根据数据是否符合双正态，分别采用了spearman或pearson相关。具体的相关如下：指标y1与x1，x2，x3...，x11之间，指标y2与x1，x2，x3...，x11之间。是以p=0.05为检验水准的。
投稿某SCI后，审稿人意见如下：Table 3 reports 13 correlations Have you adjusted for multiple comparisons? How well does each variable used correlate ? If they are highly correlated then an adjusted Bonferroni correction should be used。
问题1：如审稿人意见，我是否要分析x1，x2，x3...x11之间的相关性？
问题2：如果他们“highly correlated”，就需进行Bonferroni校正？那么怎样才算“highly correlated”？
问题3：怎样校正P值，在我这里，0.05应该除以几啊？
问题4：分析是否具有统计学意义，必须按照校正后的p值为界限吗？
不知道邀请谁？试试他们
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若能解惑，不胜感激！
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高度共线性怎么避免
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qazonly123 高度共线性怎么避免可否解答详细一点，恕我愚钝，谢谢！！！
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看你的试验目的了。当你说以p=0.05为检验水准时，是指的总体检验，还是每个独立的检验？如果前者，就得进行多重比较的调整了。后者就简单多了，什么调整也不用。但得看你是否能说服编辑了。
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hexm26 看你的试验目的了。当你说以p=0.05为检验水准时，是指的总体检验，还是每个独立的检验？如果前者，就得进行多重比较的调整了。后者就简单多了，什么调整也不用。但得看你是否能说服编辑了。我课题中，每一个独立的检验都采用p=0.05水准的，我觉得还是顺着审稿人的意见比较好啊。。。不知您可否逐个解答一下我提到的四个问题啊，十分感谢！！送您多少个叮当都可以啊，我实在是困惑。。。
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zhizihappy hexm26 看你的试验目的了。当你说以p=0.05为检验水准时，是指的总体检验，还是每个独立的检验？如果前者，就得进行多重比较的调整了。后者就简单多了，什么调整也不用。但得看你是否能说服编辑了。我课题中，每一个独立的检验都采用p=0.05水准的，我觉得还是顺着审稿人的意见比较好啊。。。不知您可否逐个解答一下我提到的四个问题啊，十分感谢！！送您多少个叮当都可以啊，我实在是困惑。。。问题1：如审稿人意见，我是否要分析x1，x2，x3...x11之间的相关性？审稿人是要你在多重比较中进行调整。你的原贴只说了相关性分析，也没有贴出Table 3。说实话，我不知道你文章中是怎么分析的，但分析x1，x2，x3...x11之间的相关性应该还没有切到主题。问题2：如果他们“highly correlated”，就需进行Bonferroni校正？那么怎样才算“highly correlated”？这个得根据你的专业知识判断。譬如测量我身上的血压值和心跳频率，两者是highly correlated；但和隔壁桌的甲某的任何测量值都是not correlated。问题3：怎样校正P值，在我这里，0.05应该除以几啊？还是老问题，得看你的模型设计中有几重比较。我没法瞎猜。问题4：分析是否具有统计学意义，必须按照校正后的p值为界限吗？我不喜欢“必须”这个词，但就你的例子而言，既然要用到多重比较调整，的确是应该用校正后的p值作为统计决断的依据。
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hexm26 zhizihappy hexm26 看你的试验目的了。当你说以p=0.05为检验水准时，是指的总体检验，还是每个独立的检验？如果前者，就得进行多重比较的调整了。后者就简单多了，什么调整也不用。但得看你是否能说服编辑了。我课题中，每一个独立的检验都采用p=0.05水准的，我觉得还是顺着审稿人的意见比较好啊。。。不知您可否逐个解答一下我提到的四个问题啊，十分感谢！！送您多少个叮当都可以啊，我实在是困惑。。。问题1：如审稿人意见，我是否要分析x1，x2，x3...x11之间的相关性？审稿人是要你在多重比较中进行调整。你的原贴只说了相关性分析，也没有贴出Table 3。说实话，我不知道你文章中是怎么分析的，但分析x1，x2，x3...x11之间的相关性应该还没有切到主题。问题2：如果他们“highly correlated”，就需进行Bonferroni校正？那么怎样才算“highly correlated”？这个得根据你的专业知识判断。譬如测量我身上的血压值和心跳频率，两者是highly correlated；但和隔壁桌的甲某的任何测量值都是not correlated。问题3：怎样校正P值，在我这里，0.05应该除以几啊？还是老问题，得看你的模型设计中有几重比较。我没法瞎猜。问题4：分析是否具有统计学意义，必须按照校正后的p值为界限吗？我不喜欢“必须”这个词，但就你的例子而言，既然要用到多重比较调整，的确是应该用校正后的p值作为统计决断的依据。这是表格截图，请您看一下！括号前面是相关系数，括号内是p值，NA表示不适用，NS表示无统计学意义（即p大于0.05）。
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zhizihappy hexm26 zhizihappy hexm26 看你的试验目的了。当你说以p=0.05为检验水准时，是指的总体检验，还是每个独立的检验？如果前者，就得进行多重比较的调整了。后者就简单多了，什么调整也不用。但得看你是否能说服编辑了。我课题中，每一个独立的检验都采用p=0.05水准的，我觉得还是顺着审稿人的意见比较好啊。。。不知您可否逐个解答一下我提到的四个问题啊，十分感谢！！送您多少个叮当都可以啊，我实在是困惑。。。问题1：如审稿人意见，我是否要分析x1，x2，x3...x11之间的相关性？审稿人是要你在多重比较中进行调整。你的原贴只说了相关性分析，也没有贴出Table 3。说实话，我不知道你文章中是怎么分析的，但分析x1，x2，x3...x11之间的相关性应该还没有切到主题。问题2：如果他们“highly correlated”，就需进行Bonferroni校正？那么怎样才算“highly correlated”？这个得根据你的专业知识判断。譬如测量我身上的血压值和心跳频率，两者是highly correlated；但和隔壁桌的甲某的任何测量值都是not correlated。问题3：怎样校正P值，在我这里，0.05应该除以几啊？还是老问题，得看你的模型设计中有几重比较。我没法瞎猜。问题4：分析是否具有统计学意义，必须按照校正后的p值为界限吗？我不喜欢“必须”这个词，但就你的例子而言，既然要用到多重比较调整，的确是应该用校正后的p值作为统计决断的依据。这是表格截图，请您看一下！括号前面是相关系数，括号内是p值，NA表示不适用，NS表示无统计学意义（即p大于0.05）。原来是这样呀，现在问题很好回答了，如果你想“顺从”编辑的话（我也推荐你如此）：
问题1：如审稿人意见，我是否要分析x1，x2，x3...x11之间的相关性？不需要。
问题2：如果他们“highly correlated”，就需进行Bonferroni校正？那么怎样才算“highly correlated”？不需要论证，这13个指标都是correlated，highly不highly的无所谓。
问题3：怎样校正P值，在我这里，0.05应该除以几啊？Bonferroni correction分别在神经生长因子的组别进行，即mRNA和NGF表达各自进行，取n=13，所以调整后的P值为0.05/23=0.0038
问题4：分析是否具有统计学意义，必须按照校正后的p值为界限吗？根据调整后的P值，HAMD和Mast cell cnt在mRNA和NGF表达都是NS了。其他的指标也会有影响。
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问题1：如审稿人意见，我是否要分析x1，x2，x3...x11之间的相关性？不需要。
问题2：如果他们“highly correlated”，就需进行Bonferroni校正？那么怎样才算“highly correlated”？不需要论证，这13个指标都是correlated，highly不highly的无所谓。
问题3：怎样校正P值，在我这里，0.05应该除以几啊？Bonferroni correction分别在神经生长因子的组别进行，即mRNA和NGF表达各自进行，取n=13，所以调整后的P值为0.05/23=0.0038
问题4：分析是否具有统计学意义，必须按照校正后的p值为界限吗？根据调整后的P值，HAMD和Mast cell cnt在mRNA和NGF表达都是NS了。其他的指标也会有影响。谢谢您，我明白您的意思了，再问您一下，是不是p值0.05应该除以12啊，因为当时因为列表的需要，在NGFmRNA和NGF蛋白表达的两列中，各有一个是NA（不适用），也就是自己跟自己做相关，当然不适用喽。其实这两个指标，都是跟12个其他指标做了相关。。。您说呢
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我这里有统计学书，需要不
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问题1：如审稿人意见，我是否要分析x1，x2，x3...x11之间的相关性？不需要。
问题2：如果他们“highly correlated”，就需进行Bonferroni校正？那么怎样才算“highly correlated”？不需要论证，这13个指标都是correlated，highly不highly的无所谓。
问题3：怎样校正P值，在我这里，0.05应该除以几啊？Bonferroni correction分别在神经生长因子的组别进行，即mRNA和NGF表达各自进行，取n=13，所以调整后的P值为0.05/23=0.0038
问题4：分析是否具有统计学意义，必须按照校正后的p值为界限吗？根据调整后的P值，HAMD和Mast cell cnt在mRNA和NGF表达都是NS了。其他的指标也会有影响。谢谢您，我明白您的意思了，再问您一下，是不是p值0.05应该除以12啊，因为当时因为列表的需要，在NGFmRNA和NGF蛋白表达的两列中，各有一个是NA（不适用），也就是自己跟自己做相关，当然不适用喽。其实这两个指标，都是跟12个其他指标做了相关。。。您说呢对，0.05当然是应该除以12，我当时没有看仔细。你甚至还可以考虑将NGFmRNA和NGF蛋白表达都剔出去，然后0.05当然是应该除以11，最后NGFmRNA和NGF蛋白表达两者进行相关性分析（但不进入总体相关性分析）。你剩下的课题就是既然NGFmRNA和NGF蛋白表达高度相关，为什么相对在某些变量上有较大的分歧，譬如VSI，TRPV1蛋白表达等等。
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学习了，非常感谢两位的一问一答，很好的解决了长期以来的疑惑，感谢！
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关于丁香园关注今日：69 | 主题：579802
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【实时交流】SCI写作投稿修回答疑解惑( 中秋厚礼-2个多月3分无版费接收)&[精华]
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请问：American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology的版面费多少？
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楼主真大牛哦！！五体投地！
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老师您好：我投稿cell cycle，under review已经第50天了。我们课题组以前有人投过该杂志，2w就修回，网上普遍说该杂志审稿时间平均4-6w，我的文章这么长时间可能是什么原因呢？您觉得我大约在什么时间询问一下编辑比较合适？我拒稿的可能性大不大呀？我指望着这篇文章毕业啊。。。老板告诉我有一个推荐的审稿人已经回复了是好的，其他还不知道，该杂志需要3个审稿人。
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baffle 编辑于
王老师您好：我从去年开始写文章投杂志，陆续投了NUCLEIC ACIDS RES（拒稿），Mol Microbiol（大修后，补了些实验没有接收），J Bac（要求补实验，没有继续投），DNA repair（大修后，补了些实验没有接收）。主要是自己的文章缺少很新的地方，内容是用遗传学的方法检测古菌中两个DNA修复蛋白的一些必需性活性，因为两个基因都敲不掉，所以用体内突变体回补加体外活性鉴定的方法来分析，最后的结果和之前其他古菌的体外活性鉴定类似，就是第一次结合遗传学方法，阐明在体内确实需要这样的活性。但是似乎创新性不够，很多杂志都不看重，感觉很郁闷。现在老板让我自己考虑选什么杂志，估计是要降一些，影响因子3-4的吧，或者3左右。您有什么建议吗，推荐一些审稿快的杂志，因为这个文章出不去，我已经第二次延期了，很着急。请您指点一二，万方感谢！
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plily 请问：American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology的版面费多少？ 如果你不选择open acess是不需要版面费的
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huangqihong 王老师您好：我从去年开始写文章投杂志，陆续投了NUCLEIC ACIDS RES（拒稿），Mol Microbiol（大修后，补了些实验没有接收），J Bac（要求补实验，没有继续投），DNA repair（大修后，补了些实验没有接收）。主要是自己的文章缺少很新的地方，内容是用遗传学的方法检测古菌中两个DNA修复蛋白的一些必需性活性，因为两个基因都敲不掉，所以用体内突变体回补加体外活性鉴定的方法来分析，最后的结果和之前其他古菌的体外活性鉴定类似，就是第一次结合遗传学方法，阐明在体内确实需要这样的活性。但是似乎创新性不够，很多杂志都不看重，感觉很郁闷。现在老板让我自己考虑选什么杂志，估计是要降一些，影响因子3-4的吧，或者3左右。您有什么建议吗，推荐一些审稿快的杂志，因为这个文章出不去，我已经第二次延期了，很着急。请您指点一二，万方感谢！ 建议你投影响因子低点的2-3分的微生物或者遗传学方面的杂志，祝好运
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如果你不选择open acess是不需要版面费的 谢谢！
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还有个问题请教：我的论文创新性好，方法也比较新颖，也有较深的机制研究，就是没有功能研究；投稿plos one以伦理问题拒稿，也提到说没有功能研究，现在伦理问题已经解决，您觉得可以投几分（发现某个恶性循环存在某疾病）？
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建议你投影响因子低点的2-3分的微生物或者遗传学方面的杂志，祝好运谢谢王老师，您知道BMC Molecular Biology和Journal of Cellular Biochemistry这2个杂志审稿时间快吗？
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王老师您好！
我是12级博士生，明年毕业，想请您指点几个适合投稿的杂志。
我主要研究方向是乳腺癌生长和转移的靶向治疗，通过单链抗体携带siRNA进行体内干涉治疗，主要体外实验数据包括WB，QRT-PCR ，流式细胞， 细胞免疫荧光（共聚焦），体内实验数据包括WB，QRT-PCR，原位及转移瘤小动物成像，原位及转移瘤生物发光，组织免疫化学，肿瘤体积及生存率分析等。现在想投一个5分以上的杂志，您能给推荐几个吗？谢谢！
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王老师，我想问一下，我发现我的三组数据分析采用的是单因素方差分析，组间两两比较用LSD显示有统计学差异，P=0.03,而Bonferroni检验两两间检验是0.08，但我作图用graphpad的T检验，比较两组间差异时，P=0.0602, 有点迷糊了，单因素方差分析两两比较是应该选用LSD还是Bonferroni？之前我在文章中没有标注的有差异，审稿人说这个图看起来有统计学差异，为什么没有标注，在讨论和结果中也不提及，我该怎么解释那？
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huangqihong 谢谢王老师，您知道BMC Molecular Biology和Journal of Cellular Biochemistry这2个杂志审稿时间快吗？ BMC的不清楚我基本上都不投这类杂志的版面费太高的，后者审稿速度还是比较快的一般一个月内的，祝好运
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jiangkuo520 王老师您好！
我是12级博士生，明年毕业，想请您指点几个适合投稿的杂志。
我主要研究方向是乳腺癌生长和转移的靶向治疗，通过单链抗体携带siRNA进行体内干涉治疗，主要体外实验数据包括WB，QRT-PCR ，流式细胞， 细胞免疫荧光（共聚焦），体内实验数据包括WB，QRT-PCR，原位及转移瘤小动物成像，原位及转移瘤生物发光，组织免疫化学，肿瘤体积及生存率分析等。现在想投一个5分以上的杂志，您能给推荐几个吗？谢谢！ mol cancer therap可以试试祝好运
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乐赢赢 王老师，我想问一下，我发现我的三组数据分析采用的是单因素方差分析，组间两两比较用LSD显示有统计学差异，P=0.03,而Bonferroni检验两两间检验是0.08，但我作图用graphpad的T检验，比较两组间差异时，P=0.0602, 有点迷糊了，单因素方差分析两两比较是应该选用LSD还是Bonferroni？之前我在文章中没有标注的有差异，审稿人说这个图看起来有统计学差异，为什么没有标注，在讨论和结果中也不提及，我该怎么解释那？抱歉从你的描述我无法判断应该用哪个，至于有差异没标注你解释下说明这次标注就可以的
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请教王老师，cancer杂志的assigning for review是代表送外审还是在找审稿人呢？
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hongruoxi 请教王老师，cancer杂志的assigning for review是代表送外审还是在找审稿人呢？我的理解是正在启动审稿程序，包括正在找审稿人，祝好运
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wangyqun 巧妙回复审稿人避免补实验，2分多SCI两天接受修回稿发表 附接受状态图 无法查看，是不是网址已经改变了呢？
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王老师您好，我做的中药单体的抗肿瘤，中药不新。机制也不复杂，就是信号通路。机制做的时候还没人做，投稿中有此单体类似机制发了，麻烦推荐合适的杂志。
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老师您好，我想请问SCI一般几个审稿，一定需要3个吗
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彭蠡 王老师您好，我做的中药单体的抗肿瘤，中药不新。机制也不复杂，就是信号通路。机制做的时候还没人做，投稿中有此单体类似机制发了，麻烦推荐合适的杂志。可以试试肿瘤药物方面的杂志比如2.57分的CANCER CHEMOTH PHARM 祝好运
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baffle 老师您好，我想请问SCI一般几个审稿，一定需要3个吗 大部分的杂志尤其是低分的杂志最后都是2个审稿人的审稿意见的，当然有不少杂志要求必须选择3个甚至4个审稿人，因为有些审稿人不一定接受审稿邀请，所以杂志社要求多推荐几个
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请问王老师，我一篇文章当前状态是“pre-acceptance proof”，已经2周了，因着急用文章，能不能催一下编辑啊？该如何询问？另外一篇也是两周前投出，目前状态是“With editor”见截图，我的问题是“Status Date”这一栏为什么是10月5号呢？表明文章已经到哪一步了啊？谢谢
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liushuzhen 请问王老师，我一篇文章当前状态是“pre-acceptance proof”，已经2周了，因着急用文章，能不能催一下编辑啊？该如何询问？另外一篇也是两周前投出，目前状态是“With editor”见截图，我的问题是“Status Date”这一栏为什么是10月5号呢？表明文章已经到哪一步了啊？谢谢1可以催问下When will it be published?2截图我没看到，不过看你的说明是with editor表示编辑正在预审你的文章，状态栏10月5日表示还是这个预审状态还没更新，等更新状态了日期才会变动，祝好运
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wangyqun 1可以催问下When will it be published?2截图我没看到，不过看你的说明是with editor表示编辑正在预审你的文章，状态栏10月5日表示还是这个预审状态还没更新，等更新状态了日期才会变动，祝好运 多谢王老师！
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感谢王老师，工作认真细致，有责任心，在他的帮助下，我的一篇SCI文章成功接受。谢谢!
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王老师：您好，我的一篇SCI文章，已经处于在线出版状态，pubmed上能查到了，但是里面的一个卡方值错误，不过不影响P值，最终的结论也不影响，我已经给杂志社发了邮件了指出这个错误，不知道杂志社能怎么处理，会影响最终的发表吗？
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luxvy 王老师：您好，我的一篇SCI文章，已经处于在线出版状态，pubmed上能查到了，但是里面的一个卡方值错误，不过不影响P值，最终的结论也不影响，我已经给杂志社发了邮件了指出这个错误，不知道杂志社能怎么处理，会影响最终的发表吗？ 首先肯定不会影响最终的发表的，纠错的问题很多杂志社在清样时一一般都明确说了这是最后的机会纠错，proof出来之后再纠错需要收取些费用的，所以建议你尽快联系杂志社要求纠正看看他们可否来得及改，或者你要想省事不纠这个不是很要紧的错也可以的，祝好运
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王老师，您好！近日我投稿至Experimental Biology and Medicine，10月8日修回后第二天状态变为associate editor decision started，但是在current stage里显示状态为Potential Reviewers Assigned，至今已经18日。我在园子里看到您曾经为该杂志审稿，不知道这样状态是否正常，能否催稿？如能得指点万分感谢！
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老师您好，我准备写一篇关于临床实验室风险管理方面的文章，第一次写英语的，要求不高，有什么容易中的杂志推荐吗？
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monkey1564 王老师，您好！近日我投稿至Experimental Biology and Medicine，10月8日修回后第二天状态变为associate editor decision started，但是在current stage里显示状态为Potential Reviewers Assigned，至今已经18日。我在园子里看到您曾经为该杂志审稿，不知道这样状态是否正常，能否催稿？如能得指点万分感谢！ 你的这个问题问的真是巧正好我前不久帮一个战友修回这个杂志，二审花了一个月的时间的好在接受了具体的历程请看附件希望对你有帮助，祝好运，有消息也请在这里跟帖反馈
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捷报再传Cell Biochemistry Function今年升到2分多了，刚刚有篇战友的论文接受了，修回后直接接受没有再二审Special Accept (Without External Review)cbf无版面费
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wangyqun 编辑于
蒋媛媛 老师您好，我准备写一篇关于临床实验室风险管理方面的文章，第一次写英语的，要求不高，有什么容易中的杂志推荐吗？ 这个杂志可以试试有一些中国人的文章发表的，祝好运
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想写肿瘤方面的综述，请王老师指点一下，给些意见！
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王老师，您好！我已经写好了CTA临床应用的文章，请问临床神经影像方面有哪些期刊容易接收 ？
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求助！求助！麻烦楼主帮我看看编辑回信！！Your manuscript has been unsubmitted to Genetic Testing and Molecular Biomarkers.
It has been unsubmitted for the following reasons.1. All authors listed on the manuscript must also be listed in Manuscript Central.2. Margins on your do they do not comply with the journal's requirements. 第一个问题是让我把所有的作者单独列出一个word重新上传吗？第二个问题是说我的文章利润太小？没有意义的意思吗？第一次投SCI不懂这里面的套路啊，麻烦大神帮帮忙！！谢谢！！
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