molpro云计算面临的问题出现的问题求助

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【求助】计算对称性相同的第二个态时出现的readm的问题已有2人参与
在计算 对称性相同的第二个态时出现
FILE 1 RECORD& & 1500 OFFSET=& && && & 0. NOT FOUND
Records on file 1
IREC& &NAME&&TYPE& && &&&OFFSET& & LENGTH& &IMPLEMENTATION& &EXT& &PREV& &PARENT&&MPP_STATE
& &1& &&&500&&VAR& && && & 4096.& &102002.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
& &2& &&&610&&BASINP& &&&106098.& &&&8192.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
& &3& &&&700&&GEOM& && & 114290.& & 23316.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
& &4& &&&900&&SYMINP& &&&137606.& &&&1067.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
& &5& &&&950&&ZMAT& && & 138673.& && & 88.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
& &6& &&&970&&AOBASIS& & 138761.& &&&1428.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
& &7& & 1000&&BASIS& && &140189.& &&&4948.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
& &8& &&&129&&P2S& && &&&145137.& && &880.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
& &9& &&&960&&ABASIS& &&&146017.& && &671.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&10& & 1100&&S& && && & 146688.& &&&6998.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&11& & 1400&&T& && && & 153686.& &&&6998.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&12& & 1410&&V& && && & 160684.& &&&6998.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&13& & 1200&&H0& && && &167682.& &&&6998.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&14& & 1210&&H01& && &&&174680.& &&&6998.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&15& & 1080&&AOSYM& && &181678.& && &224.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&16& & 1600&&SMH& && &&&181902.& &&&6996.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&17& & 1650&&MOLCAS& &&&188898.& &120695.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&18& & 1300&&ERIS& && & 729232.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &2
&&19& & 1700&&OPER& &&&.& & 21028.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
&&20& & 1380&&JKOP& &&&.&&1064499.& && && &df& && && & 0& && &0& && &0& && &1
? Record not found
? The problem occurs in readm
请高手指教
输入文件如下
&&geometry={
& && && && &C;
& && && && &N,C,r(i)}
&&r(1)=1.17 ang
&&basis={spdfgh,C,cc-pv5z-
& && && &spdfgh,N,cc-pv5z-dk}
&&do i=1,60
&&r(i)=0.+(i-1)*0.05
&&{orbital,ignore_wf,13,1,1;state,1,2}
&&{orbital,ignore_wf,13,1,1;state,1,2}
&&emr(i)=energy
&&table,r,emr
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呀!我也遇到了,同样的问题,怎么解决啊!能有解决的办法吗?
志不可满,欲不可纵。
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molpro中怎样设置只计算指定的态
我有更好的答案
都运行在linux下。在大一些的学校计算中心里服务器里一般几百上千个cpu一起工作。因为考虑到要用多cpu联合运算。像我目前在的这个实验室比较小的基本上使用了十个cpu进行运算。因为运行molpro2009这样的软件动辄就是8个cpu一起用。增加运算速度在高等级的运算级别下一个cpu基本上可以算到地老天荒了。而且根本就用不了win7做计算化学一般是不用普通台式电脑的。用的基本都是刀片服务器了
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【求助】molpro 计算问题,请高手指教!!!!已有2人参与
ERROR DETECTED
& && && && && && && && && && && && && && && && &&&**************
& &&&NON-ZERO P-SPACE GRADIENT
NON-ZERO P-SPACE GRADIENT. LARGEST VALUE:& & 0.93D+02
Probably the p-space is not closed under symmetry operations. This can happen if
the initial orbitals are not symmetry adapted or if there is root-flipping between states of
different symmetry. Try different p-space threshold, or select p-space configurations manually.
The check can be bypassed by setting thresh,pspace=thr to a larger value.
Non-zero p-space gradient elements smaller than thr are ignored.
molpro 计算时出现错误,请大家帮忙!!!!怎样才能解决这个问题,p-space这个关键词怎么用?请大家给些宝贵意见,谢谢,很急切!!!!
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★ heyo_123(金币+1):鼓励交流!!
第一次casscf计算的初始轨道不好,因为键长从HF的1.06跳到9.0。
你可以在HF用9.0,或者rvec=[1.06,1.5,2.0,3.0,...,9.0]
另外,默认的活性空间很大,你可能需要自己定义活性空间
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
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★ tiantian1358(金币+2):金币不多,请原谅,希望得到你的帮助
22:38:41heyo_123(金币+1):鼓励交流!!
通常有两个原因:
活性空间设置不合理。
来自HF或CAS的初始轨道有问题。可能是没收敛。HF还可以试试加减电荷变成闭壳层,CAS可以试试态平均。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
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能不能具体说一下,加什么关键词什么的来修正呢,活性空间怎么设置?初始轨道有问题怎么解决呢,现在问题还是没有解决,一头雾水,希望能详细指点,非常感谢!!!!
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先描述一下你的分子吧
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
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★ heyo_123(金币+1):鼓励交流!!
我的分子是N2O,分子基态为3重态对称性取的A“ 我对该分子基态对称性也有点不确定,看了些文献说是A“, 也有的是A'我的输入文件是这样的
& & memory,100,m;
& & symmetry,x;
& & geometry={O;
& && && && &&&q,O,R1
& && && && &&&N1,q,r/2,O,zeta
& && && && &&&N2,q,r/2,N1,180.0,O,0}
& & r=1.064 bohr
& & R1=20.0 bohr
& & zeta=90.0 deg
& & basis=VDZ
& & { wf,22,2,2;}
& & rvec=[9.0,8.0,7.0,6.0] bohr
& &do i=1,#rvec
& && &r=rvec(i)
& && &{ wf,22,2,2;maxiter,200,200;orbital,ignore_}
& && &ecas(i)=energy
& && &rhh(i)=r
& &table,rhh,ecas
& &table,rhh,ecas
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真的非常感谢您的帮助,我有没有其他方式可以联系你,QQ或这邮箱?非常感谢
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请问活性空间怎么设定呢?我的初始键长是1.06,我从1.0一直递增到10.0,一开始还给算,算到3.0左右的时候就出现上面的错误了,怎么办呢?后面的那些点也需要算啊,真的是太麻烦你了,十分感谢!!!
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★ heyo_123(金币+1):鼓励交流!!
说明有相同对称性的电子态交叉,需要做态平均计算。
此外,molpro默认用12个活性轨道(3个2s+3个2p),可以试试把2s放到closed空间,计算会快得多。可以查看一下hf轨道能量,把3个2s挑出来。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
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太感谢你了,我是初学者,你的话好像有点听不懂,我很想和你交朋友,以后也许有很多问题我们可以直接探讨,不知道有没有这个荣幸,我的邮箱&&如果看到的话希望你给我发邮件,
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&MOLPRO优化计算为什么如此神奇?急啊!
MOLPRO优化计算为什么如此神奇?急啊!
作者 左边8399
熟悉MOLPRO的朋友们,我想请问一个问题。我测试了水分子用直角坐标计算的例子,输入文件是这样的
memory,500,M
geomtyp=xyz& && && && && &&&
geometry={
O& && && &&&0.& & 0.& & 0.
H& && && &&&0.& & 0.& & 0.
H& && && &&&0.& & 0.& &-0.
basis=aug-cc-pvtz& && && && & !use Pople basis set
CCSD& && && && && && && && &!closed-shell scf
freq,analytical& && && &
& && && &&&
输出结果只计算到单点计算完毕不调用结构优化就结束了,如下:
&&Reference energy& && && && && && &&&-76.
&&CCSD singlet pair energy& && && && & -0.
&&CCSD triplet pair energy& && && && & -0.
&&CCSD correlation energy& && && && &&&-0.
!CCSD total energy& && && && && && & -76.
Timing summary (sec):
STEP& && && && && &&&CPU(USER)& & SYS& &&&CPU(TOT)& & WALL
Transformation& && && & 0.04& && &0.02& && &0.06& && &0.06
CCSD iterations& && && &0.14& && &0.04& && &0.18& && &0.86
Program statistics:
Available memory in ccsd:& && && && && &
Min. memory needed in ccsd:& && && && && &&&61793
Max. memory used in ccsd:& && && && && && & 69544
Max. memory used in cckext:& && && && && &
integral passes)
**********************************************************************************************************************************
DATASETS&&* FILE& &NREC& &LENGTH (MB)& &RECORD NAMES
& && && && &&&1& && &19& && &&&4.16& && & 500& && &610& && &700& && &900& && &950& && &970& &&&1000& && &129& && &960& &&&1100& &
& && && && && && && && && && && && && && &VAR& & BASINP& & GEOM& & SYMINP& & ZMAT& & AOBASIS& &BASIS& &&&P2S& & ABASIS& && &S
& && && && && && && && && && && && && &&&1400& &&&1410& &&&1200& &&&1210& &&&1080& &&&1600& &&&1650& &&&1700& &&&1380& &
& && && && && && && && && && && && && && & T& && &&&V& && & H0& && & H01& &&&AOSYM& &&&SMH& & MOLCAS& & OPER& &&&JKOP& &
& && && && &&&2& && & 3& && &&&0.33& && & 700& &&&1000& &&&2100& &
& && && && && && && && && && && && && &&&GEOM& &&&BASIS& &&&RHF&&
PROGRAMS& &*& && &&&TOTAL& && &CCSD& && &&&HF& && & INT
CPU TIMES&&*& && && &0.65& && &0.27& && &0.03& && &0.14
REAL TIME&&*& && && &1.75 SEC
DISK USED&&*& && &&&67.41 MB& && &
SF USED& & *& && && &2.80 MB& && &
GA USED& & *& && && &0.00 MB& && & (max)& && & 0.00 MB& && & (current)
**********************************************************************************************************************************
不知道是什么原因,如果用Z-MAT坐标,就可以完整地计算,麻烦有谁能告知是什么原因造成的。因为我有些相对大一点的分子,按对称性转换成内坐标很麻烦,我就是不知道用直角坐标为什么不能算,我加入symm=nosymm也不行
没见过这个错误。但是你的输入有个问题:
freq,analytical不对。molpro的ccsd方法没有解析梯度。
错了,molpro的ccsd方法没有解析频率
引用回帖:: Originally posted by beefly at
没见过这个错误。但是你的输入有个问题:
freq,analytical不对。molpro的ccsd方法没有解析梯度。 那个analytical取掉后,还是算不下去,请问您有没有在molpro算过对称性分子直角坐标输入优化的例子,我老是算不下去,也不出错,算完单点直接终止
楼主你用的molpro版本有问题吧?
我直接copy你的输入文件跑了一下,CCSD算完单点后完全可以算optg啊
引用回帖:: Originally posted by fatpig8832 at
楼主你用的molpro版本有问题吧?
我直接copy你的输入文件跑了一下,CCSD算完单点后完全可以算optg啊 我只要加上这一行“memory,500,M”就不优化结构,不设定就可以算,可是对于大的分子不设定memory内存就不够。搞不懂是不是我们装的时候设置的问题,
引用回帖:: Originally posted by fatpig8832 at
楼主你用的molpro版本有问题吧?
我直接copy你的输入文件跑了一下,CCSD算完单点后完全可以算optg啊 楼主可否方便把QQ给我,我想更快捷的与您交流,向您请教
有对称性的情况下z-matrix变量少, xyz变量多啊
所以消耗内存的量会差很多
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与700万科研达人随时交流请教molpro计算中出现的一个问题_百度知道
请教molpro计算中出现的一个问题
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这问题 不该在这里问了。计算化学用的设备不属于家用或者日常办公所需求的电脑了。 做计算化学一般是不用普通台式电脑的。用的基本都是刀片服务器了。因为考虑到要用多cpu联合运算。像我目前在的这个实验室比较小的基本上使用了十个cpu进行运算。
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