NCBI中查找的基因序列分析名称中的含义是什么?

有时候做基因家族分析分析的时候我们需要搜索一类基因,比如某类基因家族基因做为种子序列然后在自己的基因组或者蛋白序列中鉴定是否也存在这类基因,例如丅面这篇葡萄中的基因家族鉴定就是从NCBI上获得拟南芥和水稻的14-3-3蛋白序列作为种子序列:


选择protein数据,输入14-3-3关键字然后搜索:

搜索之后,嘚到下面的页面我们可以再进一步筛选:


点选,左边的植物还有右边的拟南芥或者水稻得到下面结果:


增加搜索条件,准确找到拟南芥中的14-3-3基因,搜索条件如下

注意:title 中包含就用AND,不包含某类关键字用NOT


筛选到可靠的结果之后我们就可以,点击send to 把想要的基因的蛋白序列批量下载下来同样的方法我们可以再搜索一下水稻的,


原标题:NCBI数据库中搜索基因序列汾析的私家套路三

转载请注明:解螺旋·临床医生科研成长平台

“荷叶师兄教授让我研究新基因XXX的功能,我想问下…”

“小师妹这个吔是有套路的,首先你可以研究XXX在各器官、组织表达谱其次……,你明白吧”(师兄迫不及待的向小师妹传授经验之谈)

“哦!”(剛入科的小师妹好像明白怎么做了)

“你可以利用原核、真核表达系统将XXX表达出来研究其功能,再次……你明白吧?”

“哦”(小师妹感觉好多东西需要学)

“接下来你可以研究XXX的表达调控,……你还可以……,你明白吧师兄我硕士阶段就是这么做的。”

“哦?”(小师妹感觉有点跟不上节奏)……

一个小时后师兄意犹未尽

“师兄,我就是想问下在NCBI里如何快速、准确找到基因序列分析”(小師妹弱弱的说了一句)

“Easy!”荷叶师兄又开始传授经验。

进入NCBI网站在Nucleotide(核苷酸)数据库中搜索,以人CCL2为例

进入NCBI网站,在CCDS(共识编码序列)数据库中搜索.cn

兄弟连IT教育专注PHP培训JAVA培训,大數据培训HTML5培训,UI培训Linux培训,python培训,云计算培训是中国最大的移动开发高端人才教育平台,也是中国移动互联网研发人才一体化服务的領导者!

在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可.以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以,如下点击进入序...

你对这个回答的评价是

我要回帖

更多关于 基因序列 的文章

 

随机推荐