DNAsp选择进化分析的引物 简并碱基基如何处理

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2019-05-04 06:15 标签： 简并碱基

熊荣川 中国科学院成都生物研究所

在进行种群遗传学研究时，都会用到（π）和多样性（Hd）

打开文件“taiwan30aln.fas”出现一个数据信息框，或者说软件赋予你的数据的一些默认信息

比如它会默认你的数据是来自常染色体的核基因、是二倍体型因此我们常常需要对之进行 修改以符合我们数据的实际情况，关掉这個信息框之后使用“data”-> “format”选项卡进行修改

结果中包含了我们需要的（Pi）和多样性（Hd），当然了还有很多其他相关的信息

先谢谢你哈！！其实没有你想的那么复杂！！我的意思是我的fasta文本中大约有几百条序列其中碱基除A,G,C,T,N以外还有R,Y,M,K等引物 简并碱基基，而由于DNASP软件只能识别A,G,C,T,N；所以我只能将引粅 简并碱基基替换为N；而由于我的很多序列名如：>A_Georgiak_45_2014___中含有引物 简并碱基基这些单词所以我想在不改变序列名称的条件下，将引物 简并碱基基全部转化为N所以想请教各位大神能不能帮帮忙？
  • 政治敏感、违法虚假信息
先谢谢你哈！！其实没有你想的那么复杂！！我的意思是我的fasta文本中大约有几百条序列其中碱基除A,G,C,T,N以外还有R,Y,M,K等引物 简并碱基基，而由于DNASP软件只能识别A,G,C,T,N；所以我只能将引粅 简并碱基基替换为N；而由于我的很多序列名如：>A_Georgiak_45_2014___中含有引物 简并碱基基这些单词所以我想在不改变序列名称的条件下，将引物 简并碱基基全部转化为N所以想请教各位大神能不能帮帮忙？
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