无偏期望杂合度如何计算uHe是什么意思

米心水青冈遗传多样性和遗传结構研究 摘要: 利用6对SSR引物对米心水青冈的25个居群的遗传多样性及遗传结构进行了检测分析结果表明,米心水青冈的遗传多样性(Na= 47He=0.576)偏低,供试居群的基因分化系数Fst 平均为0.1385表明14%的遗传变异存在于居群间,而86%的遗传变异存在于居群内Genetic diversity and genetic 近年来SSR作为分子标记所具有的优点使其在植物遗传图谱构建及基因或QTL的定位、物种进化与分类、品种遗传多样性、品种保护与亲子鉴定、纯度鉴定、杂种优势的机理及其预测等方面得到广泛应用[1]。与RAPD技术及AFLP技术相比微卫星技术在分析遗传多样性方面更具有优势,现已被广泛应用于农作物[2]、畜牧[3]等的分析中汾析过去的历史和现在的过程(如漂变、扩散、交配和选择、居群大小,基因流)分子标记居群遗传结构是最具价值的[]。水青冈属植物昰北半球重要建群种[]根据米心水青冈的分布特点,在安徽、浙江、湖北、湖南、四川、重庆、陕西、甘肃、广西、云南10个省市(自治区)共获得米心水青冈25个居群526份样本[6]法提取DNA并用1%琼脂糖凝胶电泳检测,在紫外分析仪上观察拍照DNA主带清晰、无弥散带、RNA去除干净则认为DNA質量较高。

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期望杂合度如何计算是理论计算得出的杂合度.
观测杂合度是随机抽取的两个样本的等位基因不相同嘚概率.计算公式如下:观测杂合度(Ho)=观察得到杂和个体数/样本个体数总数.预期杂合度值(He)根据Nei(1978)提供的公式计算:nHe =1-∑ pi 2 i=1其中pi是第i个等位形式嘚频率,所有位点的等位形式频率由软件POPGENE32计算得出,n是等位形式的数目.He值的范围从0(说明无多态性)到1(说明无限多个等位形式具有相同的频率,是个极限值
多态信息含量是指DNA的多态性指标
等位基因数是反映群体遗传变异大小的一 个指标,其数值越接近所检测到的等位基因的绝对数,表明等位基因在群体中分布越均匀.

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