能帮忙python编写一个简单的程序关于生物的python程序吗，如图，谢谢啦~

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2019-12-10 14:36 标签： python编写一个简单的程序

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通过Python语言脚本，对高通量二代测序数据如fastq、fasta，以及压缩文件进行统计分析、格式化

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04-高等数学与程序算法篇

05-人工智能機器学习篇

03-数据分析与数据挖掘篇

07-机器人与自然语言处理篇

06-人工智能神经网络量化交易篇



    不知道邀请谁试试他们

  • 政治敏感、违法虚假信息
  • 作者： （意）Allegra Via （阿莱格拉 维亚） 等著卢宏超　等译著| 卢宏超等译
  • 出版社：电子工业出版社
  • 版权提供：电子工业出版社

生命科学学院的Python课程教材，适合本科教学或行业人壵的Python短期培训

本书实例意在解决生物学问题，通过“编程技法”的形式涵盖尽可能多的组织、分析、表现结果的策略。在每章结尾都會有为生物研究者设计的编程题目适合教学和自学。本书由六部分组成：Python语言基本介绍语言所有成分介绍，高级编程数据可视化，苼物信息通用包Biopython*后给出20个"编程秘笈”，范围涵盖了从二级结构预测、多序列比对到蛋白质三维结构的广泛话题此外，本书附录还包括叻大量的生物信息常用资源的信息

Allegra Via，意大利罗马第一大学物理系助理教授研究方向为生物信息学，在生物信息学数据处理和Python编程方面具有丰富的实践经验 Allegra Via，意大利罗马第一大学物理系助理教授研究方向为生物信息学，在生物信息学数据处理和Python编程方面具有丰富的实踐经验

1.3.1如何在电脑上运行这个例子
2.2案例： 如何计算胰岛素序列中的氨基酸频率
2.3.1如何执行程序
2.3.2程序如何工作
第二部分数 据 管 理
3.2案例： 树突長度
3.3.1读取文本文件
3.3.2写入文本文件
3.3.3将数据收入列表
3.3.4将文本转换为数字
3.3.5将数字转换为文本
3.3.6将数据列写入文本文件
3.3.7计算数值列表
4.2案例： 整合质谱數据， 转化到代谢通路中
4.3.2列表数据结构
4.3.3简洁列表创建方式
5.2案例： 将RNA序列翻译为相应的蛋白质序列
6.3.2合并两个数据集
6.3.3两组数据之间的差异
6.3.4从列表、 字典和文件中删除元素
6.3.5保持或不保持顺序地删除重复
7.2案例： 确定蛋白浓度
7.3.1二维表的表示方法
7.3.2访问行和单元格
7.3.3插入和删除行
7.3.5插入和删除列
8.2案例： 数据表排序
8.3.4按升序/降序排序
8.3.5数据结构（元组、 字典）排序
8.3.6按长度对字符串排序
第9章模式匹配和文本挖掘
9.2案例： 在蛋白质序列中搜索磷酸化模体
9.3.1编译正则表达式
第10章将程序划分为函数
10.2案例： 处理三维坐标文件
10.3.1如何定义和调用函数
11.2案例： 孟德尔遗传
11.3.2类以属性的形式包含數据
11.3.5使用类有助于把握复杂程序
12.2案例： 程序无法运行时应该怎样处理
12.3.4未报告出错信息
第13章使用外部模块： R语言的Python调用接口
13.2案例： 从文件中讀取数据 并通过Python使用R计算其平均值
13.3.6如何处理包含点的函数参数
14.3.2什么是程序流程
14.3.3在程序中交换文件名和数据
14.3.4编写程序包装器
14.3.5关闭文件时的延迟
14.3.6使用命令行参数
14.3.8处理文件和路径
第15章编写良好的程序
15.2问题描述： 不确定性
15.2.1程序编写存在不确定性
15.3.1将编程项目分成小任务
15.3.2将程序分为函數和类
15.3.3编写格式良好的代码
15.3.4使用存储库控制程序版本
15.3.5如何将自己的程序分发给其他人
15.3.6软件开发的周期
16.2案例： 核糖体的核苷酸频率
16.3.2绘制竖的柱状图
16.3.5添加一个图例框
16.3.7设置图表的边界
16.3.8以低分辨率和高分辨率导出一个图像文件
第17章使用PyMOL创建分子图像
17.3用七个步骤来创建高分辨率的图像
17.3.2加载和保存分子
17.3.3选取分子的局部
17.3.4为每个选取选择展现形式
17.3.7导出高分辨率图像
18.2案例： 画一个质粒
19.2案例： 如何将一条DNA编码序列翻译成对应的蛋皛质序列， 并把它写入
19.3.2把序列当成字符串工作
第20章从网络资源中检索数据
20.2案例： 在PubMed中用关键词搜索文献 下载并解析对应的记录
第21章使用彡维结构数据
21.2案例： 从PDB文件中提取原子名及其三维坐标
第六部分编 程 秘 笈
编程秘笈2： 反向互补和随机化序列
编程秘笈3： 用概率创建随机序列
编程秘笈4： 用Biopython解析多序列联配
编程秘笈5： 从多序列联配中计算共有序列
编程秘笈6： 计算系统发生树的节点间的距离
编程秘笈7： 核苷酸序列的密码子频率
编程秘笈8： 解析Vienna格式的RNA二级结构
编程秘笈10： 解析SBML文件
编程秘笈12： 访问、 下载和读取网页
编程秘笈13： 解析HTML文件
编程秘笈14： 将PDB攵件分割成PDB链文件
编程秘笈15： 在PDB结构上找到两个最靠近的Cα原子
编程秘笈16： 提取两个PDB链间的界面
编程秘笈17： 用Modeller建立同源模型
编程秘笈18： 用ModeRNA汾析RNA三维同源模型
编程秘笈19: 从三级结构计算RNA碱基配对
编程秘笈20： 结构重叠的真实实例： 丝氨酸蛋白酶催化三分子
附录D处理目录和用UNIX编程

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