PIR与PDB有哪些有很多相同之处处

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2020-03-24 23:20 标签： 有很多相同之处

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地　址：河北省河间市沙洼工业区

描述：为了提高蛋白质预测和实验数据之间的相互吻合度PIR建立了一套系统，允许研究者们递交、分类、提取文献信息

为了提高蛋白质预测和实验数据之间的相互吻合度，PIR建立了一套系统允许研究者们递交、分类、提取文献信息。PIR提供了在超家族、域和模体水平上的对蛋白的分类PIR同时提供了蛋白的结构和功能信息，并给出了与其他40个数据库之间的相互参考PIR还提供了一个非冗余的蛋白质数据库，包括从PIR-PSDSWISS-PROT，TrEMBLGenPept，PDB收集来的约800000条序列，对每条序列给出了一个符合的名称和相关文献为了提高数据库的协同工莋能力，PIR采用开发的数据库框架利用XML技术进行数据发布。

除了蛋白质序列数据以外PIR保冷管壳还包含以下信息：

（1）蛋白质名称、蛋白質的分类、蛋白质的来源；

（2）关于原始数据的参考文献；

（3）蛋白质功能和蛋白质的一般特征，包括基因表达、翻译后处理、活化等；

（4）序列中相关的位点、功能区域

保冷管壳提供三种类型的检索服务：

（1）基于文本的交互式查询，用户通过关键字进行数据查询

（2）标准的序列相似性搜索，包括BLAST、FASTA等

（3）结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的   搜索，包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索等

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