本R教程描述了如何使用R软件和ggplot2包可视化相关矩阵
以下示例中mtcars的数據被使用。
可以使用R语言中的cor()函数创建相关矩阵:
使用reshape2包中的melt()函数将数据“融合”:
输出结果:
默认的绘图很不媄观将在下一节中看到如何更改热图的外观。
请注意如果您有大量数据,则最好使用geom_raster()函数运行更快。
注意相关矩阵具有冗余信息。可使用下面的函数将其中的一半设置为NA
# 获得相关矩阵的下三角元素
# 获得相关矩阵的上三角元素
# 获取相關矩阵cormat的上三角元素
融合相关数据并删除具有NA值的行:
负值显示为为蓝色,正值显示为红色
coord_fixed()的功能可確保x轴上的一个单位与y轴上的一个单位的长度相同。
本节介绍如何根据相关系数对相关矩阵进行重新排序这对于识別矩阵中的隐藏模式很有用。下面的示例中使用了分层聚类的hclust()函数对相关矩阵进行重新排序
对相关矩阵重新排序的辅助函数:
重新排序嘚相关数据可视化:
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