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[求助]分子生物学网站
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这个帖子发布于9年零219天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
老板要做分子生物学网站,我感觉Blast是最大的困难,请问各高手,Blast有现成的程序可用吗?或者直接给别的网站,再返回结果?谢谢了!
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你到PubMed上,把它的那个blast页面弄下来,改一下放到自己的网站上,就可以到PubMed上取回数据了:)。
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Blast工具的介绍和并行优化不知道这个对你有么帮助!
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wm_ni wrote:你到PubMed上,把它的那个blast页面弄下来,改一下放到自己的网站上,就可以到PubMed上取回数据了:)。我也想知道这方面的知识,主任能不能细讲讲?接口是不是公开的?我的意思是我想在我自己网站的核酸库里进行比对,谁有这方面的材料?这个网站是怎么实现Blast的?是自己的程序,还是用别人的程序?
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我觉得这一贴应该放到“生物信息学”版块吧?请版主转贴,让更多人进行讨论!
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网桥 wrote:我觉得这一贴应该放到“生物信息学”版块吧?请版主转贴,让更多人进行讨论!建议不错,请版主动手吧,也谢谢以上各们主任!
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我下午后来仔细看了一下,其实在PubMed官方网站上有现成的工具给你用,他们提供了一个perl语言编写的代码给你用。下载地址:
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wm_ni wrote:我下午后来仔细看了一下,其实在PubMed官方网站上有现成的工具给你用,他们提供了一个perl语言编写的代码给你用。下载地址:主任就是牛,建议加分!
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网桥 wrote:我也想知道这方面的知识,主任能不能细讲讲?接口是不是公开的?我的意思是我想在我自己网站的核酸库里进行比对,谁有这方面的材料?这个网站是怎么实现Blast的?是自己的程序,还是用别人的程序?这个网站是怎么实现Blast的,谁知道?谢谢!
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求助:纯生物信息学的文章可投向哪些国外期刊?
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这个帖子发布于6年零273天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
是关于基因组核酸序列的,个人感觉有点新东西。也花了我半年的时间处理数据,数据量感觉是够了。不做实验,可以说明一个问题的话,能投哪些期刊?我不是搞生物信息学的,这个问题也是在做实验中发现的。可能让大家见笑了。^_^谢谢了!!
zhaoyixu edited on
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关键看是哪一方面的问题,偏算法、软件开发的,可以试试Bioinformatics, BMC Bioinformatics等;偏遗传的也有遗传方面的杂志,譬如Genetics等;偏全基因组分析的,有Genomics, BMC Genomics等。
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^_^多谢了!!程序及算法主要是为处理问题而写的,我想应该属于基因组分析的,比较基因组方面的吧,是不同物种基因组之间的一个共性问题。不知都有哪些期刊可选?
zhaoyixu edited on
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zhaoyixu wrote:^_^多谢了!!程序及算法主要是为处理问题而写的,我想应该属于基因组分析的,比较基因组方面的吧,是不同物种基因组之间的一个共性问题。不知都有哪些期刊可选?高影响力到低,genome researchgenome biologyNARMBEgenome........
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谢谢!!两位ZY.
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补充一个PLOS computational biology IF=4.9我有一个朋友weixiong zhang是里面的associated editor,如果你做的东西够好,我可以帮你推荐一下msn: BMC系列的杂志都收bioinformatics的东西,就是版面费贵一点。如果是software或database,可以投NAR,每年都有一期software issue和database issue,审稿很快。另外,目前本人手上有三个database的项目,其中一个已经被NAR接收,两有两个正在筹备,有兴趣的朋友可以加我一起做。
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nkysagc wrote:补充一个PLOS computational biology IF=4.9我有一个朋友weixiong zhang是里面的associated editor,如果你做的东西够好,我可以帮你推荐一下msn: BMC系列的杂志都收bioinformatics的东西,就是版面费贵一点。如果是software或database,可以投NAR,每年都有一期software issue和database issue,审稿很快。另外,目前本人手上有三个database的项目,其中一个已经被NAR接收,两有两个正在筹备,有兴趣的朋友可以加我一起做。可惜刚学,实力不够,555
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nkysagc wrote:补充一个PLOS computational biology IF=4.9我有一个朋友weixiong zhang是里面的associated editor,如果你做的东西够好,我可以帮你推荐一下msn: BMC系列的杂志都收bioinformatics的东西,就是版面费贵一点。如果是software或database,可以投NAR,每年都有一期software issue和database issue,审稿很快。另外,目前本人手上有三个database的项目,其中一个已经被NAR接收,两有两个正在筹备,有兴趣的朋友可以加我一起做。谢谢战友!!我的也应属于基因组数据方面的,到时请你帮忙。我自己感觉是不错的。嘿嘿,只是自己的感觉,等发表了请大家评论一下。
因我不是搞这一块的,用英文写起来有些别扭。感觉新东西只能统计分析一下,证明它的存在就完了。不好随意往别的方面推断。不知如说文章推断上会引起争议,改改后还能再投吗?
那位战友有相关的文章,给我指导一下。
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是吗?但是Peer Bork这小子很hard, 下回你帮我推荐,我请你吃饭哈。先多谢一个。nkysagc wrote:补充一个PLOS computational biology IF=4.9我有一个朋友weixiong zhang是里面的associated editor,如果你做的东西够好,我可以帮你推荐一下msn: BMC系列的杂志都收bioinformatics的东西,就是版面费贵一点。如果是software或database,可以投NAR,每年都有一期software issue和database issue,审稿很快。另外,目前本人手上有三个database的项目,其中一个已经被NAR接收,两有两个正在筹备,有兴趣的朋友可以加我一起做。
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求助,生物信息学考研的问题,对数学的要求很高吗?收藏
我是学生物的,数学就大一学了点基础早就忘了,想报生物信息学。对数学的要求很高吗
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