请问,能不能根据已知引物设计查证其对应基因?如果能,请指教,详细些。谢谢!

如何利用已知基因设计特异性引物?_百度知道
如何利用已知基因设计特异性引物?
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还有一种方法是先在基因上设计引物,与其他基因同源性低的区域首先在NCBI进行blast比对,然后再这些区域设计引物,找到基因的特异序列,看看在你的目的物种中是否有同源基因,然后再blast比对引物
是不是如果我的引物与目标物种具有同源性,这对引物的特异性就比较好啊?
如果除了你的目的基因,还跟目标物种中的其他基因能比对上,那就是说明你的引物对于你的目的基因不是特异的.因为它有可能跟其他基因配对,所以不特异.特异是只能跟你的基因配对,不能跟其他基因配对~~
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出门在外也不愁能否用已知植物的某个基因序列设计引物到另一种植物里去PCR,能否得到这个基因的序列呢?这两种植物不是同一个科的!已知的是十字花科和豆科,未知的是莎草科!
老虎丶764K9
当然可以,您的这两种植物亲缘关系部是很远,没问题的!我们常说的同源克隆都利用的是这个原理,但设计引物的时候需要注意,建议设计兼并引物成功可能性会高一点!
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扫描下载二维码如何查基因引物的特异性,就是看我们的引物是不是对这个基因特异的,还是否存在于别的基因上?
荣光万丈9320
看你的引物是否落在别的基因上,类似于同源性blast.有两个方法可以来判断1.NCBI工具_Primer-BLAST——NCBI的引物设计和特异性检验工具 NCBI工具_Primer-BLAST——NCBI的引物设计和特异性检验工具 2.ucsc 网站进行primer blast .
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假如通过纯化得到蛋白质,又测了这个蛋白质的N-末端氨基酸序列,要得到这个蛋白质的编码序列,有啥方法?请大家讨论.可以采用这样的技术路线:如果蛋白为未知序列:1、找到一些你研究物种已知的mRNA及对应的蛋白序列,越多越好,通过比对找出密码子使用倾向。2、使用你所得到的n末端序列,通过建好的密码子,反向翻译为核酸序列。3、使用翻译得到的核酸序列,通过电子克隆,延长核酸序列。4、设计相应引物扩增,证实。如果为已知序列:如果你的蛋白如果是已知序列,用你得到的n端序列,通过blast应该能得到相应的完整蛋白序列,再链到核酸上去。设计引物扩增证实。我说两种,当然首先都要根据N-末端氨基酸序列设计兼并引物。第一,利用DNA文库和探针;第二,利用接头PCR,利用限制性内切酶切割基因组,然后连接接头,利用上游简并引物,下游接头引物进行PCR,即可看到战友提到电子克隆,听过一点但不是了解,能详细介绍一下吗?所谓的电子克隆,就是利用已有的序列,同核酸数据库比对,将若干条有重叠的EST序列拼接起来,形成有完整阅读框架(ORF)而得到基因全长序列,属于生物信息学策略。得到预测的序列后,可以设计相应引物验证。当然如果使用接头pcr再证实了,那结果更可信了。从你的回答中开阔了思路,谢谢。对于原核的我觉得做兼并引物的race pcr应该可以。对于兼并引物的设计,推荐大家可以看看这二个文章:人子宫颈黏液抗菌多肽的分离和鉴定。李明, 潘小玲, 王莉莉,等。中华医学杂志 2005 Vol.85 No.16 P.,或者Timothy MR, Emili RS, Jorja GH, et al. Consensus-degenerate hybrid oligonucleotide primers foramplication of distantly related sequenes. Nucleci Acids Reseach, 8-1635.这两篇文章。提供了一种设计兼并引物的特别的思路,可以减少兼并数,提高扩增敏感性。蛋白质比对已足够了如果知道N端,应该是通过5'race的方法啊。clontech公司有酶和盒子可以购买。下游引物可以通过同源性高的物种之间的比较,找到保守序列,从而设计得到的简并引物。我来发一个关于已知部分氨基酸或核酸序列如何调取整个基因方法的综述,自己写的综述,打算在组会上讲,拿来和大家共享!
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综述.part8.rar (216.64k)谢谢libinchun,方便的话把综述原文也拿出来分享,可以吗?很感谢大家感兴趣讨论这个话题,由于综述是很久以前做的,最近拿出来看了一下觉得不错发了上来,引用文献看了一下硬盘大多已经不在,如有感兴趣的可以把题目发上来,我现找。希望大家继续讨论更多的方法。其实已知N-末端和已知一段核苷酸序列来扩增其侧翼序列差不多。现在生物信息学取得了巨大发展,各种数据库也日趋完善,在这时对于这种问题,个人决的过去的科研思路有些落伍了,很可能你费死劲弄出来的东西,其实数据库中早就有人帮你做了。你做的就是整合分析数据,在验证你的预测结果。要充分利用已有数据,少作重复性工作。
您的位置: &&利用PCR技术扩增目的基因,其原理与细胞内 DNA 复制类似(如右图所示)。图中引物为单链DNA片段,它是子链合成延伸的基础。从理论上推测,
提问:级别:大二来自:天津
回答数:1浏览数:
利用PCR技术扩增目的基因,其原理与细胞内 DNA 复制类似(如右图所示)。图中引物为单链DNA片段,它是子链合成延伸的基础。从理论上推测,
利用PCR技术扩增目的基因,其原理与细胞内 DNA 复制类似(如右图所示)。图中引物为单链DNA片段,它是子链合成延伸的基础。从理论上推测,第四轮循环产物中含有引物A的DNA片段所占的比例为
&提问时间: 09:18:05
最佳答案此答案已被选择为最佳答案,但并不代表问吧支持或赞同其观点
回答:级别:一级教员 10:58:49来自:河南省洛阳市
解析:第一轮循环后的两个DNA分子中有一个含有引物A,另一个含有引物B。
第二轮循环后的四个DNA分子则是由两个含有引物A和B,但其长短并不想等;另外两个DNA分子则是一个含有引物A,另一个含有引物B。
第三轮循环后的八个DNA分子中有六个含有引物A和B,且其中有四个长短相同,另外两个与第二轮循环产生的含引物A和B的DNA相同,还有两个DNA分子同第一轮循环产物。
第四轮循环后的16个DNA分子中有12个含有引物A和B且长短相同,另外四个则与第三轮循环后的其他四个DNA相同,即两个含有引物A和B但长短不同,另外两个分别含有引物A和引物B。
综上所述,含有引物A的共有12+2+1=15个,故选A.15/16
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