195bpDNA容易降解塑料么

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【求助】DNA提取求助,急!
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这个帖子发布于6年零201天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
各位兄弟姐妹:我是一位做实验的新手,现做实验中问题重重,请帮助,先谢过。我用福尔马林固定石蜡包埋组织切片进行DNA提取,对提取的DNA进行PCR扩增。我提取DNA后测OD260和OD280表明我提的DNA应该质量上还可以(在1.6-1.9),OD值在0.1-0.3(稀释20倍后测定值).结果进行PCR扩增时老是没有扩增条带出来;而阳性对照有条带阴性对照则无,我现在判定我的PCR反应体系没有问题,应该是模板的问题。在进行DNA提取过程中我用的是QIAGEN 51304试剂盒进行提取的,扩增片段在350-450bp之间。我的问题到底在哪里呢?请高手指教!!热盼中
不知道邀请谁?试试他们
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把反应条件列出来。
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我也遇到相似的问题,不同的是我们提取的是石蜡包埋组织中的暗色真菌DNA,难度比较大。不知道各位同仁有没有做过这方面的研究,能否提供点经验,非常感谢!
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我用的是Takara的高保真Taq酶,PCR反应程序为:95度5分钟,94度30秒,53度45秒,72度60秒。进行了40循环,循环结束后72度延伸10分钟。
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两个问题:第一,阳性对照和样本什么区别,如果不涉及保密能否准确说一下是什么组织?第二,模板浓度多少?我遇到过这种情况,有可能是由于模板浓度太大或者太小造成的另外,由于是长期保存的组织,我建议你还是跑琼脂糖观察一下DNA降解的情况,如果降解很厉害,也会出现扩增失败的情况
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是这样的,我的阳性对照是从外周血淋巴细胞中提取的DNA(人基因组DNA)。而我的石蜡切片也是人的组织的石蜡切片(肺组织的)。在50ul反应体系中我用的模板量在100-500ng之间。还有如果是DNA降解的问题的话,是不是我改变引物将扩增片段适当缩短会不会好一点呢?多谢!
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yujiaping1 建议你还是跑琼脂糖观察一下DNA降解的情况,如果降解很厉害,也会出现扩增失败的情况有道理模板量降一些试试(50-100ng),加5%DMSO试试
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模版浓度不存在问题,如果DNA降解严重,可以多设计几对引物试试
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多谢各位战友的帮助,我又重新设计的两对引物,再试试。另外也加用DMSO看看能否P出来。等明日结果出来后再向各位战友汇报情况,大家相互学习。
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昨天进行了一次PCR,我降低了模板的用量(100ng),同时在反应体系中加入了DMSO,结果还正的跑出了条带,只是条带很弱,达不到测序要求的产物的量,我下一步该怎么办呢?
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用的高保真酶再加点普通的taq或者干脆用普通的taq因为你的片段都不大,现在普通的酶的变异概率也很低的
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用的高保真酶再加点普通的taq或者干脆用普通的taq为什么要用普通的taq呢?不会仅仅是价格的问题吧?
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我也遇到类似问题,我也是用蜡块提取DNA,我提了后测OD值还可以,但用琼脂糖电泳却没有任何条带,有师姐说应该是DNA降解了,我现在都不知道该怎么办了,还请各位高手给指点指点,多谢了。
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不知道你提取DNA的蜡块中有多大的组织,如果没有什么组织也会提不出DNA或者提取的DNA的量特别少
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新鲜组织的DNA比较容易扩增,蜡块要更难,一般都用试剂盒提取蜡块的DNA建议将buffer,dNTP,尤其是Taq酶换用新的,最好是都用同一家公司的
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红杉树 各位兄弟姐妹:我是一位做实验的新手,现做实验中问题重重,请帮助,先谢过。我用福尔马林固定石蜡包埋组织切片进行DNA提取,对提取的DNA进行PCR扩增。我提取DNA后测OD260和OD280表明我提的DNA应该质量上还可以(在1.6-1.9),OD值在0.1-0.3(稀释20倍后测定值).结果进行PCR扩增时老是没有扩增条带出来;而阳性对照有条带阴性对照则无,我现在判定我的PCR反应体系没有问题,应该是模板的问题。在进行DNA提取过程中我用的是QIAGEN 51304试剂盒进行提取的,扩增片段在350-450bp之间。我的问题到底在哪里呢?请高手指教!!热盼中你用的阳性对照是什么?石蜡里提取的DNA是断裂的DNA,对PCR的反应条件很苛刻的
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红杉树 各位兄弟姐妹:我是一位做实验的新手,现做实验中问题重重,请帮助,先谢过。我用福尔马林固定石蜡包埋组织切片进行DNA提取,对提取的DNA进行PCR扩增。我提取DNA后测OD260和OD280表明我提的DNA应该质量上还可以(在1.6-1.9),OD值在0.1-0.3(稀释20倍后测定值).结果进行PCR扩增时老是没有扩增条带出来;而阳性对照有条带阴性对照则无,我现在判定我的PCR反应体系没有问题,应该是模板的问题。在进行DNA提取过程中我用的是QIAGEN 51304试剂盒进行提取的,扩增片段在350-450bp之间。我的问题到底在哪里呢?请高手指教!!热盼中你用的阳性对照是什么?石蜡里提取的DNA是断裂的DNA,对PCR的反应条件很苛刻的
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hTNGα作用相关基因BRI3的研究Ⅰ小鼠BRI3基因的克隆及其功能的初步研究Ⅱ用酵母双杂合系统筛选与人BRI3相互作用的蛋白质Ⅲ人BRI3相互作用蛋白BRI3BP的基因克隆和定位论文.pdf96页
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BRIBPI 的蛋白质产物都能够与BR13蛋白相互结合.然后,将NCS1
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3秒自动关闭窗口提取DNA时,跑电泳的结果是条带主要集中在100bp左右,是不是产生降解了?还是哪里出现了问题?
dudayixiu2891
  一种可能是DNA降解形成的小片段,另一种可能是RNA没有去处干净形成的条带.
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基因组dna应该在电泳图的上端,就算降解也不可能都出现在100bp左右,应该是dna没提出来吧。。100bp比较像pcr中的引物二聚体的位置。。。
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