平时分享了好多非常好用的生物信息软件,挑几个说一下~
Geneious是一款综合性的生物信息学软件,用于分析和处理生物信息学数据,支持序列对比和系统学分析、引物设计、克隆和限制性分析、使用NCBI和EMBL,、BLAST、蛋白质结构查看、自动化医学搜索等功能。
在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天就来介绍一下如何使用在线分析工具DAVID与KOBAS的进行KEGG通路富集分析。
一般的qPCR数据,用Excel就解决了,但是遇上大量的qPCR数据,就可以试试R包。BioC中有关qPCR分析的软件包有: HTqPCR, ddCt 和 qpcrNorm,可以进行qPCR数据处理分析。
比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的,共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。Mauve是一款非常简便高效的基因组比对工具,可以用它来画基因组共线性图。下面我们就来介绍一下使用方法。
Primer Premier是设计和分析PCR引物的最全面的软件,Primer Premier 5功能强大,功能包括PCR测序引物以及杂交探针的设计、评估的,今天分享用primer5快速完成引物设计。
ContigExpress是一款非常强大的生物学软件,可以帮助大家快速的对测量序列进行序列拼接,使工作变得更加的有效率。
Evolview——一款强大的进化树在线编辑软件。它可以制作出高颜值的进化树,并且提供17种示例树,以及5个具体项目示例。
它还可以导出多种格式的文件,包括pdf、svg、tiff、png,而且绘制完成的进化树可永久性的保存在网站里,也可进行共享。
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