Tn5转移供体菌的基因工程菌产品进入受体菌。什么模式?感觉类似F因...

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利用生物信息学研究细菌水平基因转移及杆状病毒载体的改进.pdf61页
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作者签名: 壮
遥日期:丑圭!!兰
复旦大学硕士学位论文
第一章利用生物信息学研究细菌水平基因转移
水平基因转移,即不同物种问遗传物质的交换,是微生物进化和微生物多样性
的一个重要因素。细菌水平基因转移的主要途径包括转化、接合和转导。水平基因
转移的现象普遍存在于微生物界,但依靠常规实验方法并不容易找到它们在基因组
上的位置和长度。在近十年中,大量微生物基因组测序工作的完成为水平基因转移
的研究提供了很好的生物信息学平台,利用微生物基因组的序列分析研究水平基因
转移成为一个有力的手段。常见的研究方法将碱基组成和密码子偏好性定义为细菌
的基因组标签。微生物基因组中碱基组成和密码子偏好性,即基因组标签因物种而
异,因此,供体物种水平转移而来的基因和受体物种的基因组标签差异显著。本研
究基于该原理,
正在加载中,请稍后...F因子:供体菌细胞中含有一种,称为F因子。其在细菌的接合中起重要作用。细菌的接合最早在大肠杆菌中发现,以后在其他菌中也观察到,主要见于。在电镜下可观察到细菌间借伸长的进行接合。细菌能否在接合中作为供体取决于(Fertility factor)又称F因子。这是最早发现的一种质粒。F因子编码在细菌表面产生。F因子的特性为可以促进供体菌向受体菌传递染色体DNA或。F因子决定编码的可在与受体菌间形成交通通连接结构,从而可使两个细菌间形成胞浆内连接桥。F因子可以游离存在于胞浆内,也可与整合。如果F因子游离存在于胞浆内,接合时仅F因子DNA可通过胞浆的连接桥进入受体菌。然而F因子转移的特点为,从一个起始点开始,仅有一条DNA链进入受体菌,以后供体、受体菌分别以一条DNA链为模板,以另一条,形成完整的F因子。这一特性使F因子与其他能通过接合传递的细菌质粒一样,在细菌群体中传播,类似引起传染,即原来的F+菌仍为F+,而F-受体菌可变成F+菌。另外,还有F`(F右上角是一撇)的概念,F`实际上就是携带有外源染色体基因的F因子,F`和F-的杂交与F+和F-杂交的不同处是给体的部分染色体基因随F`一起转入受体细胞,并且不需要整合就可表达,实际上是形成一种,此时的受体细胞也就变成了F`。  基因的转移与重组
  &O 基因转移(gene transfer):外源性的遗传物质由供体菌进入某受体菌细胞内的过程。
  &O 基因重组(recombination):转移的基因与受体菌DNA整合在一起,使受体菌获得供体菌某些特性。
  &O 细菌的基因转移和重组方式:转化、接合、转导、溶原性转换、原生质体融合。
  1. 转化(transformation):受体菌直接摄取供体菌游离的DNA片段获得新的遗传性状的过程称为转化。
  2. 接合(conjugation)
  接合:是细菌通过性菌毛相互连接沟通,将遗传物质(主要是质粒DNA)从供体菌转移给受体菌。能通过结合方式转移的质粒称为接合性质粒,不能通过性菌毛在细菌间转移的质粒为非接合性质粒。
  F质粒的接合
  n F+ ――即F质粒,编码性菌毛,称雄性菌
  n Hfr――F质粒整合到细菌染色体上,使细菌能高效地转移染色体上的基因,故称高频重组菌
  n F’――Hfr菌中的F质粒可从染色体上脱离下来,并带染色体上几个邻近的基因,故称F’
  三者均有性菌毛,均可发生接合
  R质粒的接合
  &O 细菌的耐药性与耐药性的基因突变及R质粒的接合转移等有关。
  &O R质粒有耐药传递因子(RTF)和耐药决定子(r)两部分组成。RTF的功能与F质粒相似,可编码性菌毛的产生和通过接合转移;R决定子能编码对抗菌药物的耐药性。
  3. 转导(transduction)
  &O 转导:是以温和噬菌体为载体,将供体菌的一段DNA转移到受体菌内,使受体菌获得新的性状。
  &O 根据转导基因片段的范围,可将转导分为两类:普遍性转导(转导的DNA可是供菌染色体上的任何部分)、局限性转导(转导的DNA只限供菌染色体上的特定基因)。
  4. 溶原性转换(lysogenic conversion)
  溶原性细菌因染色体上整合有前噬菌体而获得新的遗传性状称为溶原性转换。
  5. 原生质体融合(protoplast fusion)
  G +菌形成原生质体后,在聚乙二醇(PEG)作用下,可使两种不同的细菌细胞发生融合的过程。
  融合后形成双倍体细胞,可短期生存,染色体重组,获得多种不同表型的重组融合体。
  人为实验基因转移与重组。
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转化基因(可使受体细胞发生改变的基因)的提供者是供体菌,转化基因的接受者是受体菌。
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