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[求助]细胞不同部位蛋白的提取方法
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请问一下细胞不同部位蛋白的提取方法,最近看了一些文献,比如细胞的总蛋白,膜表面蛋白,胞浆蛋白,胞核蛋白,似乎都有不同的提取方法,不知道有没有高手可以告知具体的步骤和大致的原理,非常感谢了。查看完整版本请点击这里:
caihong ( 14:32:39)
以下是我们实验室用到的方法,屡试不爽,相关成果发表在Molecular Cell上。
Chromatin Fractionation
1.about 3 × 106 cells were washed with PBS and resuspended in 200 ul of buffer A (10 mM HEPES (pH 7.9), 10mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.34 M sucrose, 10% glycerol, 1 mM dithiothreitol,0.1% Triton X-100 and protease inhibitor mixture (Roche Molecular Biochemicals).
2. the cells were incubated for 5 min on ice.
3.Nuclei were collected in the pellet (P1)by low speed centrifugation (1500 × g, 4 min, 4 °C).
4.The supernatant(S1) was further clarified by high speed centrifugation (13,000 ×g, 10min, 4 °C) to remove cell debris and insoluble aggregates. The supernatant was designated S2.
5.Nuclei were washed once with buffer A without 0.1% Triton X-100 and then lysed in 200 ul of buffer B (3 mM EDTA, 0.2 mM EGTA, 1 mM dithiothreitol, and protease inhibitor mixture).
6.After a 10min incubation on ice, soluble nuclear proteins (S3) were separated from chromatin by centrifugation (2000 ×g, 4 min).
7.Isolated chromatin (P3) was washed once with buffer B and spun down at high speed (13,000 ×g,1 min).
8.remove soup and restore the pellet(P3) in 200ul sample buffer.
owanaka ( 14:33:02)
那请问楼上的S2就是胞浆蛋白吗?
caihong ( 14:33:25)
那请问楼上的S2就是胞浆蛋白吗?
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胞浆可溶性蛋白。
hyuu ( 14:33:48)
我曾看过一篇文献,用western blot方法分别检测了线粒体内cyto c和线粒体体外的cyto c的量,请问这个是用什么方法分别获得线粒体内、外总蛋白的呢?
misswu61 ( 14:34:14)
一般来说,提细胞蛋白可以分成以下几种:总蛋白,核蛋白,胞浆内活性酶及膜蛋白等.总蛋白,一般加上样缓冲液煮煮就完事了,如果不能变性,那就用RIPA;核蛋白,市场上有专门的提取KIT,自己配试剂有点麻烦;胞浆内的活性酶,需要用不含变性剂的非常温和的缓冲液,市场上也有相应的KIT,要注意的就是让你的目的蛋白不变性,少变性;膜蛋白提取是最麻烦的,含量少,不容易被溶解,一般用NP-40,RIPA等或者一些成品KIT,但有些膜蛋白非常顽固,需要试一些去垢剂,但如果,不需要在意膜蛋白的结构,那么就使劲让它溶解变性吧,但别弄沉淀了
greenbee ( 14:34:43)
其实并不是根据细胞部位分的,而是根据蛋白性质,比如常用的percoll,
根据部位的话很难,最多也就是先吧细胞核分出来
cj_mondy ( 14:58:09)
请问与chromain紧密结合的蛋白,你们怎么提取?
貌似你说的这篇文章我看过,但是我不太明白与chromain紧密结合的蛋白,你们怎么提取的?
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以下是我们实验室用到的方法,屡试不爽,相关成果发表在Molecular Cell上。
Chromatin Fractionation
1.about 3 × 106 cells were washed with PBS and resuspended in 200 ul of buffer A (10 mM HEPES (pH 7.9), 10mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.34 M sucrose, 10% glycerol, 1 mM dithiothreitol,0.1% Triton X-100 and protease inhibitor mixture (Roche Molecular Biochemicals).
2. the cells were incubated for 5 min on ice.
3.Nuclei were collected in the pellet (P1)by low speed centrifugation (1500 × g, 4 min, 4 °C).
4.The supernatant(S1) was further clarified by high speed centrifugation (13,000 ×g, 10min, 4 °C) to remove cell debris and insoluble aggregates. The supernatant was designated S2.
5.Nuclei were washed once with buffer A without 0.1% Triton X-100 and then lysed in 200 ul of buffer B (3 mM EDTA, 0.2 mM EGTA, 1 mM dithiothreitol, and protease inhibitor mixture).
6.After a 10min incubation on ice, soluble nuclear proteins (S3) were separated from chromatin by centrifugation (2000 ×g, 4 min).
7.Isolated chromatin (P3) was washed once with buffer B and spun down at high speed (13,000 ×g,1 min).
8.remove soup and restore the pellet(P3) in 200ul sample buffer.
owanaka ( 14:58:29)
用SampleBuffer直接溶解染色体结合蛋白 as indicated above with &P3&
cj_mondy ( 14:59:06)
问一下,第五步中是用什么破核膜的?
cj_mondy ( 15:00:41)
5.Nuclei were washed once with buffer A without 0.1% Triton X-100 and then lysed in 200 ul of buffer B (3 mM EDTA, 0.2 mM EGTA, 1 mM dithiothreitol, and protease inhibitor mixture). 在你们的步骤中,其中第五个步骤说是用BufferB lysed。不知道bufferB 中什么组分可以破核膜啊?还望指点一下啊!谢谢啦!
以下是我们实验室用到的方法,屡试不爽,相关成果发表在Molecular Cell上。
Chromatin Fractionation
1.about 3 × 106 cells were washed with PBS and resuspended in 200 ul of buffer A
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以下是我们实验室用到的方法,屡试不爽,相关成果发表在Molecular Cell上。
Chromatin Fractionation
1.about 3 × 106 cells were washed with PBS and resuspended in 200 ul of buffer A (10 mM HEPES (pH 7.9), 10mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.34 M sucrose, 10% glycerol, 1 mM dithiothreitol,0.1% Triton X-100 and protease inhibitor mixture (Roche Molecular Biochemicals).
2. the cells were incubated for 5 min on ice.
3.Nuclei were collected in the pellet (P1)by low speed centrifugation (1500 × g, 4 min, 4 °C).
4.The supernatant(S1) was further clarified by high speed centrifugation (13,000 ×g, 10min, 4 °C) to remove cell debris and insoluble aggregates. The supernatant was designated S2.
5.Nuclei were washed once with buffer A without 0.1% Triton X-100 and then lysed in 200 ul of buffer B (3 mM EDTA, 0.2 mM EGTA, 1 mM dithiothreitol, and protease inhibitor mixture).
6.After a 10min incubation on ice, soluble nuclear proteins (S3) were separated from chromatin by centrifugation (2000 ×g, 4 min).
7.Isolated chromatin (P3) was washed once with buffer B and spun down at high speed (13,000 ×g,1 min).
8.remove soup and restore the pellet(P3) in 200ul sample buffer.
woshituzhu ( 15:01:05)
我要提取膜蛋白,用的是Pierce的试剂盒,可是最后一步说会有亲水层和疏水层的分层可是我做了两次就是没看到。。。郁闷死了,你们各位有谁提过膜蛋白的分享下经验吧
yysr238 ( 15:02:17)
做膜蛋白,你得用ANATRACE或者AVANTI的DETERGENTs.用那些盒子只能提部分的膜蛋白。不同的膜蛋白要用不同的DETERGENT,要不然就一个结果,沉淀。
u234 ( 15:02:41)
我养的是肌肉细胞,只要测量细胞内的总蛋白含量。我看文献后的提取方法是:
After centrifugation, protein pellet was dissolved in 1 ml NaOH 1 N and incubated at 37?C for 12 h. Soluble protein contents of the solutions were determined by spectrophotometric method using a biuret-like reaction (Protein Assay ESL, Boehringer Mannheim kit).
我想了解一下,这样提的蛋白是不是已经变性了?这对测定蛋白含量有没有影响?
反正我看western blot方法提取总蛋白的方法不是这样的,它和我上面的方法之间的差别是不是就是防止蛋白变性?
kulee ( 15:03:04)
用BIOVISION的试剂盒,这个进口的,效果比较好~~我用的就是~
lixi559 ( 15:03:29)
膜蛋白提取盒子哪个牌子好啊?
jrwyyplt ( 15:04:19)
有知道干细胞中胞核和胞膜蛋白分别怎么提取的嘛?
是不是跟一般的细胞是一样的呢?谢谢~
kswl870 ( 15:04:45)
请问一下细胞不同部位蛋白的提取方法,最近看了一些文献,比如细胞的总蛋白,膜表面蛋白,胞浆蛋白,胞核蛋白,似乎都有不同的提取方法,不知道有没有高手可以告知具体的步骤和大致的原理,非常感谢了。
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具体步骤,查文献可以收到很多不同版本,这里就不贴了:)我做过chromatin,mitochondria,membrane,nuclei,cytoplasm,以及一些特殊的膜成分,比如lipid rafts等的分离,我说点我自己理解的基本原理吧。
分离各种成分,主要有粗分离和细分离两种区别。粗分离,一般不涉及蔗糖介质以及密度梯度离心,用于大部分常规实验,文章里准确描述应该是XXXX fraction。细分离,得到的比较纯的细胞器或者某个部分,一般使用密度梯度离心,多使用蔗糖做介质,文章里可以说具体的XXXX,不加fraction这个词,比如isolation of mitochondria。
粗分离,针对不同的成分的分离方法,主要差别在于去垢剂的选择和去垢剂的作用时间的选择,也有用低渗结合匀浆破细胞分离组分的,但作为粗分离而言,去垢剂可以满足大部分要求,后面会简单提一下低渗匀浆的方法。了举数例,
1,比如分离核组分,常用NP40,因为其对核膜的破坏作用更小;
2,分离mitochondria组分,可以使用digitonin,因为线粒体外膜非常脆弱,极容易在分离时破裂,导致内外膜间许多成分释放出来;
3,分离细胞膜成分,要看实验目的,大部分膜蛋白,0.05%的triton X-100处理半小时,就可以溶解下来,因此很多时候不使用去垢剂,而使用渗透压法匀浆,然后离心分离收集。当然膜蛋白溶解,不代表膜结构破坏,因此粗分离细胞器组分时仍然可以用去垢剂处理,只要时间和浓度得当,细胞器内蛋白不会释放出来,某些细胞器结构特殊,内外两层膜,比如线粒体,自然之间的成分这样操作会释放出来;
4,分离细胞质组分,渗透压匀浆加适当转速离心即可,偷懒的话也可使用去垢剂,因为虽然许多膜蛋白会溶解在细胞质组分里,但并不影响一部分实验的目的。
5,染色体分离,相对简单很多,因为其结构比较致密,且在细胞核内,无太多特殊要求。
这里谈到的不同的去垢剂对不同细胞器的作用差别,都是需要考虑作用时间因素和浓度的,不能绝对单一化其偏好性。
粗分离常用到匀浆器,dounce glass homogenizer,不是打豆浆用的匀浆机:)。好的匀浆器是决定组分成功分离的关键所在,尤其是精细分离的第一步因为多不使用去垢剂,而靠匀浆低渗透破碎细胞,因此这一步更是决定细胞各组分完整性的关键,匀浆次数,匀浆速度,匀浆器的容积选择,匀浆器的内表面结构都是重要影响因素。比如,分离绝对纯化的线粒体,一个技巧就是用砂纸打磨匀浆器,这个有相当技巧,对一些要求极高分离实验很有效,不过一般实验用不上。如果谁能分离完整的线粒体,他就可以分离任何细胞器:)
粗分离,可以满足很多实验要求,但存在的几个问题,做实验的人必须清楚,才能在写文章,分析数据,下结论时措辞正确:
1,任何一个细胞器甚至细胞核不用密度梯度离心是无法和其它细胞器或者结构蛋白严格区分的,所以我们称之为组分。
2,细胞核虽然可以很容易和其它细胞器区分开来,但细胞骨架在粗分离实验中总是和细胞核一起离心下来,而细胞骨架有许多蛋白结合在其上,某些时候会影响结论。
3,actin不是细胞质marker,细胞核内有actin,还可以参与转录调控(常有人犯这个错误)
4,膜蛋白很容易被去垢剂溶解下来,所以涉及膜蛋白的分析,要特别小心,尽量不用用强去垢剂,或者不用去垢剂。
先写到这,以后有空再接着谈细分离
kswl870 ( 15:05:06)
我养的是肌肉细胞,只要测量细胞内的总蛋白含量。我看文献后的提取方法是:
After centrifugation, protein pellet was dissolved in 1 ml NaOH 1 N and incubated at 37?C for 12 h. Soluble protein contents of the solutions were determined by spectrophotometric method using a biuret-like reaction (Protein Assay ESL, Boehringer Mannheim kit).
我想了解一下,这样提的蛋白是不是已经变性了?这对测定蛋白含量有没有影响?
反正我看western blot方法提取总蛋白的方法不是这样的,它和我上面的方法之间的差别是不是就是防止蛋白变性?
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测定蛋白含量,蛋白变性没有关系,很多测定方法本身就引入变性过程。WB提总蛋白的方法很多,其中最简单的一种就是SDS缓冲液处理直接变性。
hyuu ( 15:05:32)
我发了一个国外提取蛋白的protocol,见链接
查看完整回复请点击这里:百度拇指医生
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验证码输入错误,请重新输入马尾松树皮提取物对癌细胞内硫氧还蛋白还原酶的影响--《时珍国医国药》2012年10期
马尾松树皮提取物对癌细胞内硫氧还蛋白还原酶的影响
【摘要】:目的探索马尾松树皮提取物(PMBE)对体外培养的人肺腺癌细胞Glc-82、肝癌细胞Bel-7402和宫颈癌细胞Hela内的硫氧还蛋白还原酶(TrxR)的抑制作用。方法运用四甲基偶氮唑蓝(MTT)比色法、酶联免疫吸附法(ELISA)、NADPH还原反应和DCF荧光法检测细胞存活率及癌细胞内的TrxR浓度、TrxR活性和活性氧(ROS)水平。结果 MTT和ELISA检测未见PMBE所引起的三种癌细胞内TrxR蛋白含量的明显升高;在生理条件及氧胁迫下,PMBE均可显著抑制三种癌细胞内的TrxR活性;ROS测定说明氧胁迫下PMBE不能有效降低三种癌细胞内的ROS水平。结论 PMBE能够有效抑制人体呼吸、消化和生殖系统的三种癌细胞内的TrxR活性,并降低了其对氧胁迫的耐受性。
【作者单位】:
【关键词】:
【基金】:
【分类号】:R285.5【正文快照】:
硫氧还蛋白还原酶(TrxR)是一种二聚吡啶核苷酸二硫化物氧化还原酶。哺乳动物TrxR具有C端保守位点“-Cys-Sec-”,可还原硫氧还蛋白(Trx)或氢过氧化物等非二硫化物底物[1]。肿瘤细胞的TrxR在含量和活性上都高于正常组织,这也是肿瘤对化疗耐受的重要因素[2~4]。近来,以肿瘤细胞T
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【参考文献】
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石蜡包埋组织microRNA快速提取试剂盒(离心柱型)
石蜡包埋组织microRNA快速提取试剂盒(离心柱型)
无氯*仿RNA提取试剂盒(离心柱型)
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血液(液体样本)microRNA快速提取试剂盒(离心柱型)III代全国独家
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血液总RNA和总蛋白快速提取试剂盒(离心柱型)
注:原为RP2601与RNase-free DNase重复
(离心柱型)
病毒RNA提取试剂盒(溶液型)
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(离心柱型)
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植物直接PCR 试剂盒
动物组织直接PCR试剂盒(不需液氮研磨)
高效总蛋白裂解抽提试剂盒
细胞核蛋白/浆蛋白抽提试剂盒
生物素化的β- 半乳糖苷酶
5片装邮寄夹
100个/包装
乳酸脱氢酶(LDH)测试盒
100管/48样
多酚氧化酶(PPO)测试盒
100管/48样
铜蓝蛋白含量测试盒
100管/48样
植物类黄酮测试盒
100管/48样
植物总酚测试盒
100管/48样
植物原花青素测试盒
100管/48样
总巯基测试盒
100管/48样
多酚氧化酶(PPO)测试盒
100管/48样
植物叶绿体总蛋白提取试剂盒
Na+k+ ——ATP酶测试盒
100管/48样
Ca++Mg++ ——ATP酶测试盒
100管/48样
硝酸还原酶测试盒
100管/48样
NO含量测试盒
100管/48样
谷丙转氨酶(GPT)测试盒
100管/48样
谷草转氨酶(GOT)测试盒
100管/48样
组织及血液酸性磷酸酶(ACP)测试盒
100管/48样
组织及血液碱性磷酸酶(AKP/ALP)测试盒
100管/48样
乳酸脱氢酶(LDH)测试盒
100管/48样
酸性蛋白酶测试盒
100管/48样
中性蛋白酶测试盒
100管/48样
碱性蛋白酶测试盒
100管/48样
胃蛋白酶测试盒
100管/48样
α-淀粉酶测试盒
100管/48样
β-淀粉酶测试盒
100管/48样
酸性转化酶(AI)测试盒
100管/48样
中性转化酶(NI)测试盒
100管/48样
还原糖含量测试盒
100管/48样
β-木糖苷酶测试盒
100管/48样
氨基比林-N-去甲基化酶(AND)测试盒
100管/48样
苯胺-4羟化酶(AH)测试盒
100管/48样
红霉素-N-脱甲基酶(ERND)测试盒
100管/48样
NO含量测试盒
100管/48样
β-1,3葡聚糖酶(β-1,3-GA)测试盒
100管/48样
辅酶ⅠNAD(H)含量测试盒
100管/96样
辅酶ⅡNADP(H)含量测试盒
100管/96样
NADP磷酸酶(NADPase)测试盒
100管/96样
还原型谷胱甘肽(GSH)测试盒
100管/96样
总抗氧化能力(T-AOC)测试盒
100管/96样
羟自由基清除能力测试盒
100管/96样
苯丙氨酸解氨酶(PAL)测试盒
100管/96样
水土中亚硝酸盐含量测试盒
100管/96样
食品中亚硝酸盐含量测试盒
100管/96样
氨基酸(AA)含量测试盒
100管/96样
半胱氨酸(Cys)含量测试盒
100管/96样
谷氨酸(Glu)含量测试盒
100管/96样
羟脯氨酸(HYP)测试盒
100管/96样
柠檬酸(CA)含量测试盒
100管/96样
丙酮酸(PA)测试盒
100管/96样
淀粉含量测试盒
100管/96样
植物组织果糖含量测试盒
100管/96样
蔗糖酶测试盒
100管/96样
蔗糖合成酶(SS)测试盒
100管/96样
蔗糖磷酸合成酶(SPS)测试盒
100管/96样
植物组织果糖含量测试盒
100管/96样
海藻糖含量测试盒
100管/96样
山梨醇含量测试盒
100管/96样
NADPH-细胞色素C还原酶(NCR)测试盒
100管/96样
细胞色素b5含量测试盒
100管/96样
血钾浓度测试盒
100管/96样
血钙浓度测试盒
100管/96样
血清铁浓度测试盒
100管/96样
血镁浓度测试盒
100管/96样
血磷浓度测试盒
100管/96样
血钠浓度测试盒
100管/96样
血锌浓度测试盒
100管/96样
组织无机磷含量测试盒
100管/96样
组织总磷含量测试盒
100管/96样
单胺氧化酶测试盒
100管/96样
双缩脲法蛋白含量测试盒
100管/96样
双缩脲法蛋白含量测试盒
100管/96样
考马斯亮蓝法蛋白含量测试盒
100管/96样
考马斯亮蓝法蛋白含量测试盒
100管/96样
现GMS12024.1
胰蛋白酶(0.05%)乙二胺四乙酸混合液
植物叶绿体总蛋白提取试剂盒
现GMS12024.2
胰蛋白酶(0.25%)乙二胺四乙酸混合液
现GMS12050
青链霉素混合液
现GMS12051.3
无激素精制胎牛血清
现GMS12199.1
人体胚胎干细胞完全培养基
现GMS12199.2
小鼠胚胎干细胞完全培养基
现GMS12199.3
大鼠胚胎干细胞完全培养基
现GMS12059.1
EDTA二钾血液抗凝液
现GMS12059.2
EDTA三钾血液抗凝液
现GMS12059.3
EDTA钠血液抗凝液
现GMS12059.5
肝素钠血液抗凝液
现GMS14009.1
(种系)体外卵母细胞成熟(in vitro maturation;IVM)培养液
现GMS12011
BLOTTO 10核酸杂交封闭溶液
现GMS12071
50倍Dendhart核酸杂交封闭溶液
现GMS12085
分子生物级溴化乙锭(Ethidium Bromide)染色液(1毫克/毫升)或(10毫克/毫升)
现GMS12107
通用AP酶联检测封闭溶液
现GMS12071
50倍Dendhart核酸杂交封闭溶液
现GMS12124
10倍TBS浓缩缓冲溶液
现GMS12131
10倍PBST浓缩缓冲清理溶液
现GMS12144
HRP反应终止缓冲液
现GMS12001
细菌冻存培养基
现GMS12002
特殊细菌营养基
现GMS12074.1
酵母菌YPD培养基
酵母菌SD-GAL/RAF培养基
10倍酵母菌SD-GAL/RAF培养基
酵母菌SD-LEU/TRP培养基
10倍酵母菌SD-LEU/TRP培养基
酵母菌SD-LEU培养基
10倍酵母菌SD-LEU培养基
酵母菌SD-TRP培养基
10倍酵母菌SD-TRP培养基
酵母菌SD-HIS培养基
10倍酵母菌SD-HIS培养基
10倍酵母菌SD-URA培养基
酵母菌SD-LEU/TRP/HIS培养基
酵母菌SD-TRP/URA培养基
10倍酵母菌SD-TRP/URA培养基
酵母菌SD-TRP/HIS/ADE培养基
10倍酵母菌SD-TRP/HIS/ADE培养基
酵母菌SD-ADE培养基
酵母菌SD-TRP/HIS培养基
酵母菌SD-TRP/HIS/ADE/LEU培养基
现GMS12098.2
10倍M9培养基
现GMS12398
红酵母菌培养基
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