如何确定某一种基因的功能？_进化论吧_百度贴吧
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如何确定某一种基因的功能？收藏
在基因工程这门技术停滞在专注于研究基因分离、转入的时代里，转曾是困扰科学家的一大难题。然而，凡事都是有弊必有利。随着对转基因沉默研究的逐渐深入，科学家发现，转基因沉默似乎打开了一扇新的大门：既然植物能够天然利用同源或者互补的RNA或DNA序列，在RNA以及DNA水平上调控基因的表达，那么我们为什么不效仿天然，探索的奥秘呢？ 　　他们首先想到，每个物种在进化过程中都会由于突变或者其他原因带有一些对自身不好的基因，如果这些基因不幸落在某个个体身上，并且基因正常表达，那个个体就会患有遗传病。如果想个办法不让这个坏基因表达，问题不就解决了吗？于是，他们就利用RNA干扰——这个曾让Jorgensen培育紫色的梦想流产的机制来解决这个问题，他们给这个办法起名，叫做基因敲除，也叫做。　　具体做法是，在已知坏基因序列的情况下，就知道了它转录的mRNA序列，这样只要合成一段与mRNA序列互补的小片段RNA，把它注射到细胞内，和坏基因的mRNA形成双链DNA，就可以把这些坏mRNA降解掉。用这种抱着敌人同归于尽的办法，就可以最大程度地消除坏基因的影响，而无需转入新的基因或者注入其它药物。现在，在农作物方面，基因敲除已经成为了品种改良的一个主要做法。 　　人体内有30000个基因，其他的生物体内的基因数量也数以万计。如何确定某一种基因的功能？“我不在，你就想到我的重要性了。”科学家用的就是这个办法。他们用基因敲除的办法，暂时让某个基因失去功能，然后观察分析生物体出现了哪些异常，进而就可以推断基因的大致功能。这就是基因敲除技术在功能性上的应用。 　　转对科学家的困扰已经成为多年前的过去，如今，科学家已经掌握了更好的基因定位和时空特异性表达等调控技术，他们研究的热点是基因编码。想象一下，科学家将像我们在电脑上编辑文章一样，对基因组进行拼写检查，字句修订……当然，你可以对新技术保持乐观，也可以保持悲观，这是你个人的选择，但是最好是保持客观。作者:许秀华
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”人体内有30000个基因” 这得是多少年前的事情了．．．
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【求助/交流】如何确定未知基因编码氨基酸～
目前在水稻中克隆到2个拟南芥和小麦同源基因（A，B功能相似）～～
做了RACE拿到全长：
A基因比对过拟南芥和小麦后，以及NCBI上的注释，编码区可以确定
B基因NCBI的注释基本就是错的，但与拟南芥和小麦的编码区比较后可以确定其保守结构，拟南芥中也存在两个相似功能基因，其中一个有信号肽，氨基酸序列较长～～
这两个基因没有被克隆过，所以我无法确定其编码区，请问如何获得其确切的氨基酸编码区，如果要把两个基因提交到ncbi，是不是要确定其氨基酸编码区。以前做拟南芥相关基因的文章，是制备了抗体以后，进行杂交后，测得N端5个氨基酸序列，目前这个方法是否可行，另外抗体制备据说可以用蛋白质或者特异性的肽段，如果编码区未确定，把蛋白来制备抗体是不是不好？
目前蛋白质测序好像都是用质谱，但蛋白点怎么分离，是不是用ELISA，有没有什么基础书籍推荐，图书馆最近搬迁，书都找不到了
另外，求几个基因预测或启动子预测软件和网站
本人对蛋白质技术是个菜鸟，望大家为我答疑解惑，不胜感激～～
另补充下，现在课题进展到这个阶段，下一步怎么安排有点困惑～～
我的目的是验证两个基因的功能，方法就是找突变体（用RiceGE找插入突变），找得到先做突变体，找不到直接转基因进行验证，但是我又怕序列只是预测的，怕出错，那就麻烦了～～
有人建议我先得到蛋白质完整序列，这期间可以先培养材料，或者测定下酶活以及做做生理生化，但我感觉这样时间不够，做水稻转基因周期较长～～
有人建议我可以先用拟南芥做材料转一下，看看表现如何，如果好的话，在转水稻～～
目前很迷茫，实验室刚刚起步，蛋白质这块刚刚开始做，课题也是我自己找的，所以很多东西都要自己去找，但是很多方向性的问题也不敢自己做决定，没把握，希望大家提点意见和建议，谢谢～～ 大家帮帮忙。。。。 Originally posted by shaquila at
目前在水稻中克隆到2个拟南芥和小麦同源基因（A，B功能相似）～～
做了RACE拿到全长：
A基因比对过拟南芥和小麦后，以及NCBI上的注释，编码区可以确定
B基因NCBI的注释基本就是错的，但与拟南芥和小麦的编码区 ... Where did you get the sequence?&&from gDNA or cDNA?
If you can get gDNA and cDNA of your gene, you can use some software to get the open reading frame from ATG---------TAA/TAG/TGA. If there is not intron, your gDNA sequence is enough for encoding region. Originally posted by shaquila at
另补充下，现在课题进展到这个阶段，下一步怎么安排有点困惑～～
我的目的是验证两个基因的功能，方法就是找突变体（用RiceGE找插入突变），找得到先做突变体，找不到直接转基因进行验证，但是我又怕序列只是预测 ... you also can do its locailzation by Agribacteria mediated tabacco otransformation or gene gun
and do its over- expression or deletion in arabidopsis and if it is possible, you also can test its function in yeast
these data are more indirect but it takes less time and energy
more direct data should come from rice but i know it takes time to get knock out plants or overexpression plant
good luck Originally posted by wangleisdnu at
Where did you get the sequence?&&from gDNA or cDNA?
If you can get gDNA and cDNA of your gene, you can use some software to get the open reading frame from ATG---------TAA/TAG/TGA. If there is n ... 发了7，8个论坛，你是唯一回帖的，真是太感谢了
是cDNA序列，确切的是拿到了全长mRNA序列，UTR区和CDS，在线预测和同源比对，结果应该差不多了，但是不是有必要拿到准确的蛋白质序列呢，如果不拿到会不会被人质疑，那有什么方法拿到呢？
其中有一个基因我预测了一下，前面有个信号肽结构，这个是不是在运输时候可能会被切掉，这样序列不是也无法确定，当然如果序列能拿到，即使是部分，通过三联体密码子3个3个向前推，最后可以确定ATG～～
所以我想知道有没有什么通用的protocol，可以获得位置基因的编码区，谢谢～～ Originally posted by wangleisdnu at
you also can do its locailzation by Agribacteria mediated tabacco otransformation or gene gun
and do its over- expression or deletion in arabidopsis and if it is possible, you also can test ... 嗯，你说的方法确实有可行性
我也想这么做，初步做做比较好转，好分析的宿主，同时可以做做亚细胞定位和gus组织分析，同时在转水稻，因为水稻周期较长，这期间够做很多事，娃哈哈～～
但是问题还是仍然存在，编码区是不是要确定呢？看见有人把可能的编码区都哪去构建载体，我们实验室就是预测了个编码区，就哪去做转化，我觉得挺没底的，不知你有何看法 Originally posted by wangleisdnu at
you also can do its locailzation by Agribacteria mediated tabacco otransformation or gene gun
and do its over- expression or deletion in arabidopsis and if it is possible, you also can test ... 不需要蛋白序列 Originally posted by wangleisdnu at
不需要蛋白序列 嗯，我看很多文章也没有，只是拿到全长后预测下，有的设置连全长都没拿，谢谢拉
var cpro_id = 'u1216994';
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本人现在大三 很菜 在准备毕业论文的东西 有个东西实在搞不懂
我的课题是把乳酸菌的产胞外多糖的基因导到大肠杆菌里去表达
遇到了个问题 我想不通 大家帮帮我 看我除了上面问题
老师现在让我们先提基因组 因为会失败很多次 让我们慢慢摸索
在提基因组的过程中让我们思考关于设计引物的事情
我的思路是 设计引物的话就要知道他的序列是怎么样的
我的菌种是05级的一个学长筛选出来了 我看了他的毕业论文内容 只鉴别到是革兰氏阳性 杆菌 高产
于是我在NCBI上对乳酸菌的galU基因进行了搜索
出现了10个不同的基因序列
我不知道我要怎么从这10个里知道 哪个才是我要的可以用来设计引物的。。。
高手帮帮我啊~~~~~~~~~~~~
提问者： [] [] []
回答者： [] [] []
一级 一星助者
他最初应该是16SRNA鉴定的菌株名称，在NCBI上比对，找相似度最高的，然后找目的基因
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其他回答 (1)
首先比较一下你搜到的10个目的基因的同源性，我认为同源性应该是很高的，所以用哪个应该问题不大，也可以问问老师，你们的菌种到底是那一株，在去NCBI上面查找。
回答者： 一级 一星助者
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