全基因组序列分析重组序列在分子标记研究中的应用有哪些

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DNA分子标记及其在水产动物研究中的应用
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你可能喜欢日信息:& & 摘要 DNA分子标记是继形态标记、细胞学标记、生化标记之后发展起来的一种新的更为理想的遗传标记,它促进了植物遗传育种的研究,在花卉研究中也得到了广泛的应用。叙述分子标记的主要类型、原理和特点,以及它在花卉的亲缘关系分析、品种鉴定和分类、遗传多样性、遗传图谱的构建和辅助育种等方面的研究应用概况。
& & 关键词 分子标记;花卉;应用
& & 分子标记是一种新型的遗传标记,它不受环境条件和发育时期等因素的影响,可代表物种本身遗传特性,已经成为研究植物遗传育种的有力工具。近年来,国内外许多学者利用分子标记对花卉植物开展了不少研究。
& & 1、分子标记的分类
& & 分子标记(Molecular marker)是指与特定基因或标记连锁的一段经过扩增并可检测出的DNA序列。DNA分子标记大多以电泳谱带的形式表现,大致可分为两大类。第一类是以分子杂交为核心的DNA分子标记,主要包括限制性片段长度多态性标记(RFLP);第二类是以聚合酶链式反应(PCR)为核心的DNA分子标记,包括随机扩增多态性DNA标记(RAPD)、简单序列重复标记(SSR )、重复序列之间长度多态性(ISSR)、扩展片段长度多态性标记(AFLP)等。
& & 1.1RFLP标记
& & RFLP是利用限制性内切酶切割生物体基因组DNA而产生的长短、种类、数目不同的限制性片段的技术,这些具有差异性的DNA片段通过已克隆和标记的DNA片段作为探针进行Southern杂交,然后再放射自显影或非同位素来检测DNA的多态性。RFLP具有技术稳定、重复性好、无表性效应、等位基因之间共显性、非等位基因之间不存在上位效应、标记数量多等优点,是最有效的共显性DNA分子标记;但RFLP分析的探针制备、酶切、转膜、分子杂交、放射自显影等过程需花相当的经费和时间,并且不同物种需制备不同的探针。
& & 1.2RAPD标记
& & RAPD标记是用一系列的单链随机引物(通常为10碱基)对基因组DNA进行PCP扩增,检测特异DNA片段,得到多态性标记的技术。该标记技术的主要优点是速度快、费用低、引物不受物种限制、标记数量多、DNA用量少、对环境污染小等,易于运用;缺点是该标记为显性标记,不能区分纯合和杂合基因型,稳定性较差,且易产生非特异性带。
& & 1.3AFLP标记
& & 其基本原理是利用一个对基因组DNA酶切位点少的酶和另一个酶切位点多的酶组合,对基因组DNA进行酶切,再用人工接头与酶切片段的粘性末端连接作为模板,先进行预扩增,之后再进行选择性PCR扩增,最后通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测多态性。AFLP标记的优点是稳定性强、重复性好、多态性高,具有显性或共显性;其缺点是步骤繁琐,对模板反应迟钝,成本高。
& & 1.4ISSR标记
& & ISSR标记根据基因组内广泛存在的微卫星基因序设计单一引物,对基因组DNA进行扩增,扩增的指纹图同时提供基因组内多个位点序列信息。ISSR通常为显性标记,且具有很好的稳定性和多态性。与SSR相比,ISSR-PCR引物不需预先的DNA测序,减少了预备工作,但有些ISSR引物可能在某些基因组DNA中因没有配对区域而无扩增产物;与AFLP相比,ISSR在DNA用量、实验繁琐程度和费用上占优势;与RAPD相比,ISSR揭示的多态性较高,精确度与RFLP相当。
& & 1.5SSR标记
& & 在真核生物基因组DNA中广泛存在1~6个核苷酸组成的短的、串联的简单重复序列(SSR),又称为微卫星,SSR两端有一段相对保守的单拷贝DNA序列,根据这段序列设计出特异双引物,对重复区域进行PCR扩增,再经聚丙烯酰胺凝胶电泳检测扩增片段的多态性即为SSR标记。由于SSR标记的多态性仅由简单序列重复次数的差异引起的,通常表现为共显性,可鉴别纯合子和杂合子。它的缺点是要克隆足够数量的SSR需要足够的人力、物力和时间,还要针对每类SSR的两端序列设计特异引物,工作量很大。
& & 2、DNA分子标记在花卉研究中的应用及进展
& & 2.1种质资源鉴定
& & 长期以来,各种花卉异地相互引种,杂交及突变,品种名和品种分类十分混乱。因此,对现有花卉品种准确的鉴定和分析十分重要,而分子标记技术为品种鉴定提供了新手段。Ballard[1]等对22个月季的栽培品种进行了RFLP和RAPD分析,鉴定出其中的20个月季品种,结果表明,所有以抗病和感病为亲本的4倍体月季品种表现出较高的遗传多态性,所以抗病和感病的杂交后代适合遗传图谱的建立。
& & 于燕莉[2]采用RAPD标记方法对金银花中的大毛花金银花、鸡爪花金银花品系进行鉴定,使用35个随机引物进行扩增实验,结果大毛花金银花共扩增DNA谱带24条;鸡爪花金银花共扩增DNA谱带26条,从而区分2个形态极为相似的品系。
& & 明军[3]等利用梅花AFLP多态位点信息,从178个梅花品种及近缘(品)种构成的群体中,选取了52个品种样品进行了梅花品种资源核心种质的构建。
& & 2.2亲缘关系及分类研究
& & 应用分子标记进行植物的分类及亲缘关系分析,可以在分子水平上阐明生物系统演化及分类情况,也直接关系到育种亲本的选配和种质资源的合理有效利用。2000年,周春玲[4]利用AFLP技术,对菊属植物12个分类群的亲缘关系进行分析,结果表明,所选的2个栽培品种滁菊和亳菊可归并为一个品种,该品种与毛华菊、野菊、甘菊亲缘关系相对较近,与紫花野菊的亲缘关系次之,而与小红菊的亲缘关系相对最远。
& & 王献[5]利用AFLP来研究的亲缘关系,结果表明,矮生品种间的亲缘关系较近,他们中的粉润和矮生垂枝粉的关系最近;具有优异性状的品种白蝶飞舞和层云积雪的关系较近,红蝶飞舞和蓝色妖姬的关系也较近,而与白密香的关系较远;2个普通的白花品种紫爪银薇和白云映霞的关系较近。
& & 张俊祥[6]采用AFLP技术对云南省兰属的14个种和3个变种中的38份样本进行了亲缘关系分析,16对AFLP引物扩增的条带聚类结果表明,云南省国兰遗传多样性非常广泛,相同品种间的不同扩增出的条带模式相差很大。
& & 林丽美[7]用RAPD 技术对百合属的4种商品药材百合进行了鉴定。
& & 刘小莉[8]对报春花属10个种的种间变异进行了ISSR分析,将这10个种明显地聚为了三大类。
& & 于恒秀[9]利用ISSR引物鉴定栽培品种间的亲缘关系。
& & 苏雪[10]应用RAPD技术对栽培的16种紫斑品种的分类进行了初步研究。
& & 赵喜华[11]对11种杜鹃属植物进行了RAPD分析,基于DNA分子水平探讨了杜鹃属植物种间的亲缘关系和系统位置。
& & 2.3遗传多样性研究
& & 保护生物多样性已成为国际热点问题,其核心内容是遗传多样性的保护。遗传多样性主要是指种内不同居群之间或同一居群不同个体之间的遗传变异的总和。遗传多样性会反映在DNA水平上,因此近年来,DNA分子标记被广泛地应用于植物遗传多样性和遗传结构的研究中。石胜友[12]用8对引物对变叶30个不同的变异类型进行了AFLP分析,从DNA水平上探明了变叶海棠的遗传多样性是变叶海棠与陇东海棠和花叶海棠产生渗入杂交形成的。侯小改[13]利用荧光标记AFLP技术对30份牡丹栽培品种进行了总基因组DNA水平上的多态性检测,结果共获得1 123 条可统计的条带,其中965条呈多态性,多态性带百分率达86%,揭示了牡丹栽培种质丰富的遗传多样性。田晔林[14]用RAPD分子标记技术分析8个一串红品种DNA的多态性,30个引物扩增出162条DNA谱带,119条是多态性的,多态性占73.5%,这表明了RAPD技术是检测一串红品种遗传多样性的有效工具,并为优良品种的遗传改良提供了选配育种亲本的依据。
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你可能喜欢DNA分子标记技术在植物系统学研究中的应用--《中国生物多样性保护与研究进展——第五届全国生物多样性保护与持续利用研讨会论文集》2002年
DNA分子标记技术在植物系统学研究中的应用
【摘要】:本文概述了DNA分子标记在植物系统学中的应用,介绍了其技术手段、对象基因的选择以及研究的现状和发展趋势。主要技术手段有DNA分子标记(RFLP,PCR-RFLP,RAPD,SSR,ISSR,AFLP,SS(P等)以及对DNA进行直接序列分析。植物体内的各种DNA都可能成为研究对象,包括叶绿体、线粒体和细胞核的DNA。叶绿体基因组中常用的有编码基因rbcL,matK,ndhF,atpB,非编码区序列rpL16,rps16,rpoC1,trnL-F,trnT-L,PY-IGS等,其中rbcL,matK用的最为普遍。线粒体基因组中matR,nad5,nad2等序列也可用做系统分析。核基因组中常用的序列主要集中在编码核糖体RNA的重复区(nrDNA)内,包括26S rDNA,5.8S rDNA,18S rDNA以及内转录间隔区ITS,其次是一些低拷贝数目的基因,如PGI和adh。用分子生物学方法来研究生物学各领域的问题已经成为一种发展趋势,在植物系统学领域已取得很多的成果,解决了一些经典分类学的难题。而分子系统学与生物信息学的交叉,更使得这一领域有着广阔的发展空间。
【作者单位】:
【关键词】:
【分类号】:Q941【正文快照】:
1前言生命在漫长的历史演化中形成了如今丰富多样的生物世界,并在维护人类生存与发展方面发挥着十分重要的作用(马克平等,1994)。为了能更好地了解并保护生物及生态系统,对生物多样性和系统进化的研究必不可少。因此,人们力求建立一个能反映生物界真实进化过程和亲缘关系
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赵厚涛;宋培浪;韩国营;陈倩;;[J];北方园艺;2010年21期
中国硕士学位论文全文数据库
贾俊忠;[D];石河子大学;2010年
【参考文献】
中国期刊全文数据库
吕宝忠;[J];动物学研究;1993年02期
辛业芸;[J];湖南农业科学;2002年04期
庄丽,陈月琴,李钦亮,屈良鹄;[J];海洋与湖沼;2001年02期
何兴金,葛颂,许介眉,洪德元;[J];中国科学C辑:生命科学;2000年02期
李健仔,李思光,罗玉萍,万璐;[J];江西科学;2002年03期
安瑞生,谭声江,陈晓峰;[J];昆虫知识;2002年03期
卢孟柱,王晓茹,AlfredE.S[J];林业科学研究;2000年04期
石福臣,陆兆华,李立芹;[J];植物研究;2001年03期
苏乔,栾日孝,安利佳,祖元刚;[J];植物研究;2002年01期
罗静,张亚平;[J];人类学学报;2000年02期
【共引文献】
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王际振;刘亚琼;杨兵;王献;;[J];山东农业科学;2008年08期
马荣群;宋正旭;黄粤;岳文辉;;[J];山东农业科学;2009年06期
陈凌云;刁英;杨新笋;胡中立;;[J];安徽农学通报;2006年09期
熊向阳;;[J];安徽农学通报;2008年06期
罗海燕;陈业渊;;[J];安徽农学通报;2008年19期
陈复生,付承玉,汪泰初;[J];安徽农业科学;2003年04期
蔡光泽;杨足君;刘成;任正隆;;[J];安徽农业科学;2006年23期
王佳;胡永红;张启翔;;[J];安徽农业科学;2006年24期
冀玉良;;[J];安徽农业科学;2008年04期
郭治友;;[J];安徽农业科学;2008年11期
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汪维云;;[A];中医药理论与应用研究——安徽中医药继承与创新博士科技论坛论文集[C];2008年
钟建兴;方民杰;;[A];中国南方十六省(市、区)水产学会渔业学术论坛第二十六次学术交流大会论文集(上册)[C];2010年
郑小艳;蔡丹英;滕元文;鲍露;张东;;[A];中国园艺学会第十届会员代表大会暨学术讨论会论文集[C];2005年
武荣花;王雁;彭镇华;李振坚;;[A];2007年中国园艺学会观赏园艺专业委员会年会论文集[C];2007年
罗淑萍;孙晋科;曾斌;李疆;;[A];第五届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2007年
张永春;褚云霞;靖相密;汤庚国;杨柳燕;;[A];中国园艺学会球根花卉分会2008年会暨球根花卉产业发展研讨会论文集[C];2008年
武荣花;王雁;彭镇华;李振坚;;[A];中国观赏园艺研究进展(2010)[C];2010年
牟少华;孙振元;彭镇华;高志民;郭起荣;;[A];中国观赏园艺研究进展(2010)[C];2010年
高亚梅;韩毅强;余丽芸;;[A];高教科研2006(中册:教学改革)[C];2006年
赖家业;刘凯;石海明;兰健;尹承颖;罗荡平;冯家勋;陈放;;[A];第三届南方林木育种研讨会论文(摘要)集[C];2006年
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孙庆华;[D];山东农业大学;2009年
杨凡;[D];电子科技大学;2011年
童旭宏;[D];浙江大学;2011年
赵博;[D];武汉大学;2010年
闫小玲;[D];浙江大学;2010年
郭意;[D];西南大学;2011年
翁天均;[D];西南大学;2011年
姜英淑;[D];东北林业大学;2009年
王靖;[D];四川农业大学;2011年
陈发波;[D];四川农业大学;2010年
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郑瑜;[D];华中农业大学;2010年
吴茜;[D];华中农业大学;2010年
郭彦斌;[D];山东农业大学;2010年
杨天慧;[D];山东农业大学;2010年
霍凤梅;[D];山东农业大学;2010年
魏成湘;[D];辽宁师范大学;2010年
梅丽;[D];辽宁师范大学;2010年
姜媛秀;[D];辽宁师范大学;2010年
吴林园;[D];安徽农业大学;2010年
蒋燕锋;[D];浙江农林大学;2010年
【同被引文献】
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黄健锋;陈定如;;[J];广东园林;2008年01期
田佺;杨润清;宁海龙;李文斌;;[J];上海交通大学学报(农业科学版);2005年04期
李嘉涵;杨润清;;[J];上海交通大学学报(农业科学版);2006年06期
霍建勇,刘静,冯辉;[J];沈阳农业大学学报;2005年02期
刘杨,陈火英,魏毓棠;[J];沈阳农业大学学报;2005年02期
杨武亮,姚振生,舒任庚,盛晓静;[J];时珍国药研究;1996年04期
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李君明;[D];中国农业科学院;2005年
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张孝峰;[D];内蒙古农业大学;2006年
李红;[D];西南大学;2006年
徐明磊;[D];西南大学;2006年
高永利;[D];东北农业大学;2006年
王天奎;[D];西北农林科技大学;2007年
张强;[D];南京农业大学;2007年
王娟;[D];南京农业大学;2007年
【二级引证文献】
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胡刚;胡光平;王桂萍;朱忠荣;刘正华;韩堂松;;[J];种子;2012年12期
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库
李靖炎;[J];动物学研究;1988年02期
刘次全,黄京飞,王莹;[J];动物学研究;1990年02期
张亚平;[J];动物学研究;1996年03期
赵中秋,郑海雷,张春光;[J];生命科学研究;2000年S1期
郑敏,罗玉萍;[J];生物技术;1999年03期
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陈叙龙,张清敏,张毓琪,张宝东,陈素平;[J];环境化学;1994年03期
周晓慧;[J];承德医学院学报;1998年02期
张爱民,张建民;[J];菏泽师范专科学校学报;1998年02期
房经贵,章镇,刘大钧,马正强,JossiH[J];植物生理学通讯;2000年01期
朱长军,张利宁,马春红,曹英林,宋静;[J];山东医科大学学报;2000年01期
张秀花,弓巧娟;[J];山西大学学报(自然科学版);2000年01期
宗仁鹤,白春礼,李振刚,汪新文,聂焰,龚为穗,杨安庆,龚立三;[J];激光生物学报;2001年01期
张李阳;[J];南京晓庄学院学报;2002年04期
徐治立;[J];系统辩证学学报;2002年03期
罗文永,陈建伟,刘彦卓,肖昕,毛兴学,李晓方;[J];广东农业科学;2004年02期
中国重要会议论文全文数据库
高巾帼;田兴军;陈彬;朱静;杨昌林;李重琦;宋福强;;[A];中国生物多样性保护与研究进展——第五届全国生物多样性保护与持续利用研讨会论文集[C];2002年
刘海英;陈刚;步宇翔;;[A];中国化学会第28届学术年会第13分会场摘要集[C];2012年
邹丹丹;汪海林;;[A];中国化学会第28届学术年会第2分会场摘要集[C];2012年
邢永政;刘冬生;;[A];2011年全国高分子学术论文报告会论文摘要集[C];2011年
程巳雪;陈思;赵东;卓仁禧;;[A];2011中国材料研讨会论文摘要集[C];2011年
邢永政;杨忠强;刘冬生;;[A];中国化学会第28届学术年会第3分会场摘要集[C];2012年
周晓萍;肖鹏;吕雪飞;邓玉林;;[A];全国生物医药色谱学术交流会(2010景德镇)论文集[C];2010年
张泉;苏都莫日根;;[A];中国植物学会植物细胞生物学2010年学术年会论文摘要汇编[C];2010年
赵元彪;胥慧;何群;;[A];中国菌物学会第五届会员代表大会暨2011年学术年会论文摘要集[C];2011年
赵文杰;汤超;王彩娟;刘军伟;卢奎;;[A];中国化学会第十二届全国应用化学年会论文集[C];2011年
中国重要报纸全文数据库
刘霞;[N];科技日报;2010年
常丽君;[N];科技日报;2011年
冯卫东;[N];科技日报;2008年
许文强;[N];大众科技报;2008年
陈超;[N];科技日报;2010年
冯卫东 聂翠蓉;[N];科技日报;2008年
刘霞;[N];科技日报;2008年
陈丹;[N];科技日报;2010年
冯卫东;[N];科技日报;2010年
何屹;[N];科技日报;2011年
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徐铁刚;[D];上海交通大学;2008年
高鹏;[D];吉林大学;2011年
梅传忠;[D];复旦大学;2010年
崔鹏;[D];山东大学;2010年
李敏;[D];南开大学;2010年
杨恩成;[D];吉林大学;2010年
郭烁;[D];大连海事大学;2010年
张黎明;[D];山东大学;2010年
吴初新;[D];南昌大学;2010年
赵魁;[D];吉林大学;2010年
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李金京;[D];吉林大学;2011年
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吴文化;[D];内蒙古农业大学;2010年
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