题主所说的自己APP的协议应该是指Custom Url Scheme（下面就称为scheme吧）scheme在iOS7、8下工作正常，但升级到iOS9以上版本时如果没有安装某个APP的情况下尝试通过APP预定义的scheme唤起APP时会有一个题主描述的错誤提示，这个提示目前没有方法可以去掉

iOS9提供了一个更安全的方法来通过浏览器或其他的web容器唤起APP的解决方案，那就是universal link这也是苹果官方自iOS9以后主推的深度链接（deeplink）实现方案，但是universal link的配置和实现要复杂得多关于Universal Link的详细介绍可以在苹果官方开发文档里面找到，也可以看看這篇文章：